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비영리법인 토지 양도 후 수익사업 개시 시 과세특례 적용 여부

2010두3763
판결 요약
비영리내국법인이 수익사업을 영위하지 않던 기간에 토지를 양도하고, 같은 사업연도 내에 수익사업을 시작한 경우에도 구 법인세법 제62조의2 과세특례를 적용할 수 있다는 점을 명확히 한 판결입니다. 자산양도소득 발생 시점을 기준으로 세제 특례 적용 여부를 판단해야 하며, 이후 수익사업 개시 여부와는 무관하다고 보았습니다.
#비영리법인 #토지양도 #수익사업 #법인세 #과세특례
질의 응답
1. 수익사업이 없던 비영리법인이 토지 양도 후 그 해에 수익사업을 개시한 경우 과세특례를 받을 수 있나요?
답변
예, 양도 당시 수익사업을 하지 않았다면 그 사업연도에 수익사업을 시작했더라도 과세특례를 적용받을 수 있습니다.
근거
대법원 2010두3763 판결은 비영리내국법인이 토지를 양도할 때 수익사업을 하지 않았다면, 그 해 수익사업을 개시하더라도 양도소득에 대해 과세특례 적용이 가능하다고 판시했습니다.
2. 비영리법인의 수익사업 영위 시점은 과세특례 적용 판단에 어떻게 영향을 주나요?
답변
양도소득 발생 당시의 사업 여부가 기준이 되며, 이후 같은 연도에 수익사업을 해도 적용에 영향이 없습니다.
근거
대법원 2010두3763 판결은 '수익사업 영위 비영리법인'은 양도소득 발생 시점을 기준으로 판단해야 한다고 보았습니다.
3. 구 법인세법 제62조의2의 입법 취지는 무엇인가요?
답변
자산양도소득에 대한 법인세 부담이 양도소득세보다 과중하지 않도록 조정하려는 것입니다.
근거
대법원 2010두3763 판결은 비영리법인은 영리 추구가 아니므로 부담이 불합리하게 커지지 않도록 과세특례 제도를 두었다고 밝혔습니다.

* 본 법률정보는 대법원 판결문을 바탕으로 한 일반적인 정보 제공에 불과하며, 구체적인 사건에 대한 법률적 판단이나 조언으로 해석될 수 없습니다.

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판결 전문

법인세 부과 처분 취소

 ⁠[대법원 2012. 1. 26. 선고 2010두3763 판결]

【판시사항】

수익사업을 영위하지 않는 비영리내국법인인 甲 재단법인이 토지를 양도한 후 같은 사업연도 내에 수익사업인 부동산임대업을 개시한 사안에서, 甲 법인이 토지 양도로 얻은 양도소득에 대하여 과세특례조항인
구 법인세법 제62조의2를 적용할 수 있다고 본 원심판단은 정당하다고 한 사례

【판결요지】

수익사업을 영위하지 않는 비영리내국법인인 甲 재단법인이 토지를 양도한 후 같은 사업연도 내에 수익사업인 부동산임대업을 개시한 사안에서,
구 법인세법(2006. 12. 30. 법률 제8141호로 개정되기 전의 것, 이하 같다) 제62조의2의 문언 체계 및 수익사업을 영위하지 않는 비영리법인은 영리를 추구하는 법인이 아닌 점을 고려하여 자산양도소득에 대한 법인세 부담이 양도소득세보다 과중하여지지 않도록 하려는 입법 취지 등에 비추어, 甲 법인이 수익사업을 영위하지 않던 기간에 토지를 양도하여 양도소득이 발생했으므로, 그 후 같은 사업연도 내에 수익사업을 영위했더라도 양도소득에 대하여 과세특례조항인
구 법인세법 제62조의2를 적용할 수 있다고 본 원심판단은 정당하다고 한 사례.

【참조조문】

구 법인세법(2006. 12. 30. 법률 제8141호로 개정되기 전의 것) 제3조 제2항 제1호(현행
제3조 제3항 제1호 참조),
제62조의2 제1항,
제2항


【전문】

【원고, 피상고인】

재단법인 대유원 ⁠(소송대리인 법무법인 랜드마크 담당변호사 최성훈)

【피고, 상고인】

강서세무서장

【원심판결】

서울고법 2010. 1. 21. 선고 2009누18396 판결

【주 문】

상고를 기각한다. 상고비용은 피고가 부담한다.

【이 유】

구 법인세법(2006. 12. 30. 법률 제8141호로 개정되기 전의 것, 이하 ⁠‘법인세법’이라 한다) 제62조의2 제1항은 비영리내국법인( 법인세법 제3조 제2항 제1호에서 규정하는 수익사업을 영위하는 비영리내국법인을 제외한다)은 토지 또는 건물의 양도로 인하여 발생하는 소득(이하 ⁠‘자산양도소득’이라 한다)이 있는 경우에는 제60조(과세표준 등의 신고) 제1항의 규정에 불구하고 과세표준의 신고를 하지 아니할 수 있다고 규정하고, 같은 조 제2항제1항의 규정에 의하여 과세표준의 신고를 하지 아니한 자산양도소득에 대하여는 소득세법 제92조(양도소득과세표준의 계산)의 규정을 준용하여 계산한 과세표준에 같은 법 제104조(양도소득세의 세율) 제1항 각 호의 세율을 적용하여 계산한 금액을 법인세로 납부하여야 한다고 정하고 있다(이하 ⁠‘이 사건 과세특례조항’이라 한다). 그리고 법인세법 제3조 제2항 제1호는 제조업, 건설업, 부동산임대업 등의 수익사업(이하 ⁠‘수익사업’이라 한다)을 열거하고 있다.
원심은 그 채용 증거를 종합하여, 수익사업을 영위하지 않는 비영리내국법인인 원고가 2003. 9.경 이 사건 토지를 양도한 후 같은 사업연도 내인 2003. 12.경 수익사업인 부동산임대업을 개시한 사실 등을 인정한 다음, 법인세법 제62조의2 제1항 소정의 ⁠‘수익사업을 영위하는 비영리내국법인’은 위 규정의 문언 체계상 ⁠‘양도소득이 발생할 당시 수익사업을 영위하는 비영리내국법인’이라고 새기는 것이 자연스러운 점, 이 사건 과세특례조항이 적용되면 법인세법 제62조의2 제7항에 따라 자산양도일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내에 양도소득과세표준 예정신고 및 자진납부를 하여야 하므로 자산양도시점을 기준으로 이 사건 과세특례조항의 적용 여부를 선택할 수 있어야 하는 점 등을 종합적으로 고려하여 볼 때, 원고가 수익사업을 영위하지 아니하던 기간에 이 사건 토지의 양도로 인한 양도소득이 발생하였으므로 그 후 같은 사업연도 내에 수익사업을 영위하였더라도 위 양도소득에 대하여 이 사건 과세특례조항을 적용할 수 있다고 해야 한다고 판단하였다.
앞서 본 규정의 문언 및 수익사업을 영위하지 않는 비영리법인은 영리를 추구하는 법인이 아닌 점을 고려하여 자산양도소득에 대한 법인세 부담이 양도소득세보다 과중하여지지 않도록 하려는 이 사건 과세특례조항의 입법 취지 등에 비추어 볼 때, 원심의 위와 같은 판단은 정당하고, 거기에 상고이유로 주장하는 법인세법 제62조의2의 해석·적용에 관한 법리 등을 오해하여 판결에 영향을 미친 위법이 없다.
그러므로 상고를 기각하고, 상고비용은 패소자가 부담하도록 하여 관여 대법관의 일치된 의견으로 주문과 같이 판결한다.

대법관 박보영(재판장) 박일환 신영철(주심) 민일영

출처 : 대법원 2012. 01. 26. 선고 2010두3763 판결 | 사법정보공개포털 판례