양도소득세에서 포괄양수도 대금 중 권리금·주식대금 구분 기준

창원지방법원 2011구합1090
판결 요약
EE환경이 BB기계에 사업과 토지를 포괄양도한 거래에서, 원고는 포괄양수도 대금 중 일부 5억 원을 권리금, 5,000만 원을 별도 토지대금으로 주장하며 쟁점토지 양도가액을 13억 9,000만 원으로 보아야 한다고 다투었습니다. 그러나 법원은 ① 가족회사 구조, ② 쟁점토지 매매계약서상 금액이 기준시가의 약 60% 내외에 불과하고 실제 거래과정과 부합하지 않는 점 등을 들어 계약서를 실제 매매계약서로 보기 어렵다고 판단하였습니다. 또한 포괄양수도 대금 45억 원 중 주식대금 15억 원을 제외한 나머지는 부동산 매매대금으로 보아야 하고, 원고가 주장한 5억 원의 권리금과 5,000만 원의 별도 토지대금도 모두 토지 매매대금의 일부라고 보았습니다. 이에 따라 쟁점토지의 양도가액은 포괄양수도 전체 부동산 가액 20억 5,000만 원을 기준시가 비율로 안분한 2,029,676,000원으로 확정되었고, 과세관청의 양도소득세 경정·고지 처분은 적법하다고 판단하였습니다.
#포괄양수도 양도소득세 #권리금 부동산대금 구분 #주식대금 산정 기준 #기준시가 60% 매매계약서 #실질과세 원칙 국세기본법 제14조
질의 응답
1. 포괄양수도 거래에서 일부 금액을 권리금이라고 주장하면 양도소득세 계산 시 인정받을 수 있나요?
답변
포괄양수도 거래에서 대금 중 일부를 권리금이라고 주장하시려면, 그 금액이 실제로 유형자산인 토지나 건물 대금이 아니라 영업권·무형자산 대가라는 점이 객관적으로 입증되어야 합니다. 이 사건에서는 포괄양수도 대금 45억 원 중 15억 원은 EE환경 주식대금으로 보되, 나머지 30억 원 전부를 부동산 매매대금으로 보았고, 원고가 주장한 5억 원 권리금도 토지대금의 일부로 인정하였습니다. 포괄양수도 회사가 사실상 적자 상태였고, 주식 전부가 통상적인 가치인 15억 원에 양도되었으며, 양도인들이 주식양도로 인한 양도차익이 없다고 신고한 점 등을 근거로, 주식대금 외에 별도의 권리금을 인정할 만한 사정이 없다고 본 것입니다.
근거
창원지방법원 2011구합1090 판결은, EE환경과 BB기계 사이 포괄양수도에서 포괄양도·양수대금 45억 원 중 15억 원은 EE환경 주식대금으로, 나머지는 부동산 매매대금으로 보았습니다. 재판부는 ① 2005년 표준대차대조표상 EE환경 총 주식가액이 약 15억 원이고 실제로도 그 금액에 양도된 점, ② EE환경 순자산가액이 580,871,640원에 불과하고 적자 회사였던 점, ③ 원고가 주장하는 5억 원 권리금에 관하여도 포괄양도·양수대금 중 주식대금을 제외한 나머지는 부동산 매매대금이라는 대표이사의 진술 등을 종합하여, 5억 원은 권리금이 아니라 토지 매매대금 중 일부라고 판단하였습니다(국세기본법 제14조 제2항 적용).
2. 포괄양수도 시 주식 양도대금과 토지·건물 매매대금을 어떻게 구분하나요?
답변
포괄양수도에서 주식 양도대금과 부동산 매매대금을 구분할 때에는 명칭보다 실질에 따라 판단되며, 회사의 재무제표, 순자산가액, 영업상황, 주식수와 주당가액, 실제 지급 구조가 중요하게 고려됩니다. 이 사건에서는 ① 2005년도 EE환경 표준대차대조표상 총 주식가액이 15억 원이었고, 실제로도 주식 전부를 15억 원에 양수한 점, ② 순자산가액이 약 5억 8,000만 원에 불과한 적자 회사였던 점을 근거로 15억 원 전부를 주식대금으로 인정하였습니다. 반면, 포괄양도·양수대금 45억 원 중 15억 원을 제외한 나머지 금액은, 주식과 별도로 양도된 사업장 부지 등 부동산에 대한 대가로 보아 토지 매매대금으로 평가하였습니다.
근거
창원지방법원 2011구합1090 판결은 국세기본법 제14조 제2항에 따라 과세표준 계산에서는 명칭보다 실질 내용이 우선한다고 전제한 뒤, ① EE환경 2005년 법인세 신고 첨부 표준대차대조표상 주식 1주당 가액 10,000원, 총 주식가액 약 15억 원, ② 순자산가액 580,871,640원, ③ 2006년 자본금 증자 후에도 주식 전부가 15억 원에 양도된 점을 들어 포괄양수도 대금 45억 원 중 15억 원을 주식대금으로 한정하였습니다. 그리고 포괄양도·양수대금 중 주식대금을 제외한 나머지는 부동산 매매대금으로 보아야 한다고 판시하였습니다.
3. 포괄양수도 과정에서 작성한 토지 매매계약서 양도가액이 기준시가의 60% 수준이면 세법상 실제 계약서로 인정되기 어렵나요?
답변
토지 매매계약서상 양도가액이 기준시가의 약 60% 수준에 불과하고 거래 구조나 자금 흐름과 명백히 어긋나면, 세무당국과 법원에서 이를 실제 매매계약서로 인정하지 않을 수 있습니다. 이 사건에서는 쟁점토지에 대한 평균감정가와 기준시가에 비추어 계약서상 13억 9,000만 원은 2006년 기준시가의 약 68.5%, 2007년 기준시가의 약 58.1%에 그쳤습니다. 또, 가족회사 간 거래, 포괄양수도 직후 시차를 둔 형식적 계약 체결, 실제 수수된 총 대금과 계약서 간 불일치 등이 확인되어, 재판부는 2006. 12. 20.자 쟁점토지 매매계약서를 실제 매매계약서로 보기 어렵다고 보았습니다.
근거
창원지방법원 2011구합1090 판결은, ① 쟁점토지 평균감정가액(2006.12.18. 기준)이 1,374,647,000원이고, 매매계약서상 양도가액 1,390,000,000원이 2006년 기준시가 대비 68.5%, 2007년 기준시가 대비 58.1%에 불과한 점, ② EE환경 주식 전부가 이미 BB기계에 양도된 이후 원고가 EE환경에게 토지를 양도한 형식인 점, ③ 원고가 BB기계·EE환경으로부터 받은 금액과 개별 매매계약서상 금액이 일치하지 않는 점 등을 종합해, 2006. 12. 20.자 토지 매매계약서를 실제 매매계약서로 보기 어렵다고 판단하였습니다. 이에 따라 국세기본법 제14조 제2항에 따라 형식이 아닌 실질에 따른 과세가 이루어져야 한다고 보았습니다.
4. 포괄양수도에서 부동산을 함께 넘긴 경우 토지 양도가액은 어떻게 안분·산정되나요?
답변
포괄양수도에서 여러 필지 토지 등이 함께 양도되고 개별 가액이 명확하지 않을 경우, 세법은 전체 부동산 대금을 기준시가 비율에 따라 각 토지별 양도가액으로 안분하도록 하고 있습니다. 이 사건에서 법원은 포괄양수도 거래를 통해 원고 소유 각 토지가 총 20억 5,000만 원에 양도된 것으로 본 뒤, 그 금액을 2006년도 각 토지의 기준시가에 비례하여 안분한 결과 쟁점토지의 양도가액은 2,029,676,000원이라고 보았습니다. 이러한 안분은 구 소득세법 및 그 시행령, 부가가치세법 시행령의 규정을 근거로 합니다.
근거
창원지방법원 2011구합1090 판결은, 포괄양수도로 양도된 이 사건 각 토지의 총 양도가액을 20억 5,000만 원으로 본 후, 구 소득세법 제100조 제2항, 구 소득세법 시행령 제166조 제4항, 부가가치세법 시행령 제48조의2 제4항을 근거로 2006년도 기준시가 비율에 따라 각 토지 양도가액을 안분해야 한다고 판시하였습니다. 그 결과 쟁점토지의 양도가액은 기준시가 비례 안분액인 2,029,676,000원으로 보아야 하고, 이에 터잡은 과세관청의 양도소득세 경정·고지 처분은 적법하다고 보았습니다.
5. 가족회사 사이 포괄양수도와 토지 거래가 결합된 경우 세무조사에서 어떤 점을 특히 주의해야 하나요?
답변
가족 또는 특수관계인이 지배하는 회사들 사이의 포괄양수도와 토지 거래가 결합된 경우, 세무당국과 법원은 거래의 명칭보다 실질을 엄격하게 따지는 경향이 있습니다. 이 사건에서 법원은 ① 원고와 가족들이 EE환경 주식을 대부분 보유하고 있던 점, ② 남편이 원고를 대신해 포괄양수도 계약을 체결하고 BB기계로부터 받은 대금을 가족·법인 계좌 사이에서 순환시킨 점, ③ 이후 형식적으로 작성된 여러 매매계약서의 가액 합계가 주장하는 금액과 맞지 않는 점 등을 근거로, 토지 양도자가 실질적으로는 원고이고 EE환경 명의 이전은 편의에 불과하다고 보았습니다. 따라서 이러한 구조에서는 실제 자금 흐름, 기준시가·감정가 대비 거래가, 계약일자와 등기·양도일의 일치 여부 등을 객관적으로 정리하여, 형식과 실질이 일치하도록 설계·입증하시는 것이 중요합니다.
근거
창원지방법원 2011구합1090 판결은, ① 원고의 남편 김GG이 포괄양수도 계약 체결 당시 원고 소유 토지까지 포함해 양도하고 BB기계 대표이사에게 송금 대상을 지정한 점, ② 원고와 가족이 EE환경 주식의 대부분(2006.10.16. 기준 150,000주 중 145,000주, 계약 당시 74,500주)을 보유했던 점, ③ 원고가 BB기계·EE환경으로부터 합계 19억 9,000만 원을 수령한 뒤에야 EE환경 대표이사에게 일부를 송금한 점, ④ 각 토지 매매계약서 작성 시기와 금액 합계가 실제 주장과 맞지 않는 점을 종합하여, 실질 양도자는 원고이고 EE환경 명의 이전은 편의에 불과하다고 보았습니다. 이에 따라 국세기본법 제14조 제2항의 실질과세 원칙을 적용하여 양도소득세를 인정하였습니다.

* 본 법률정보는 대법원 판결문을 바탕으로 한 일반적인 정보 제공에 불과하며, 구체적인 사건에 대한 법률적 판단이나 조언으로 해석될 수 없습니다.

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판결 전문

요지

신고시 제출한 매매계약서상 양도가액은 기준시가 대비 60% 내외에 불과한 점 등에 비추어 실제 매매계약서로 보기 어렵고 포괄양도・양수대금 중 주식대금을 제외한 나머지는 부동산 매매대금이므로 권리금으로 주장하는 금액은 토지 매매대금 중 일부로 봄이 타당함

판결내용

판결 내용은 붙임과 같습니다.

상세내용

사 건

2011구합1090 양도소득세부과처분취소

원 고

박AA

피 고

김해세무서장

변 론 종 결

2011. 11. 17.

판 결 선 고

2012. 1. 19.

주 문

1. 원고의 청구를 기각한다.

2. 소송비용은 원고가 부담한다.

청구취지 

피고가 2010. 3. 10. 원고에 대하여 한 양도소득세 299,442,550원의 부과처분을 취소한다.

   이 유

1. 처분의 경위

 

가. 원고는 2003. 3. 24. 별지 부동산 목록 1. 내지 6. 기재 각 토지(이하 ’이 사건 각 토지’라 한다)를 취득하여, 2004년경 건설폐기물 중간처리 및 재활용골재생산업 등을 영위하는 EE환경산업(이하 ’EE환경’이라 한다)에게 이 사건 각 토지를 보증금 3억 원에 임대하였다.

나. EE환경은 2006. 12. 1. 주식회사 BB기계(이하 ’BB기계’라 한다)와 EE환경의 사업 및 자산을 BB기계에게 포괄적으로 양도함과 아울러 이 사건 각 토지도 양도하는 계약(이하 ’이 사건 계약’이라 한다)을 체결하였다. 한편, EE환경은 2006. 12. 20. 원고와 별지 부동산 목록 1., 2. 기재 각 토지(이하 ’이 사건 쟁점토지’라 한다)를 원고로부터 매수하는 매매계약서를 작성하고, 같은 달 22. 이 사건 쟁점토지를 취득하였다.

다. 원고는 2007. 2. 28. 피고에게 이 사건 쟁점토지에 대하여 양도가액 1,390,000,000원, 취득가액 945,000,000원, 필요경비 155,529,000원, 양도차익 289,471,000원(= 1,390,000,000원 - 945,000,000원 - 155,529,000원)으로 산정 하여 양도소득세 예정신고를 하고 이에 따른 양도소득세 73,069,740원을 납부하였다.

라. 피고는 2010. 3. 10. 원고에게 ’이 사건 쟁점토지의 양도가액이 2,013,006,307원, 취득가액이 903,038,723원, 필요경비가 155,529,000원, 양도차익이 954,438,584원(= 2;013,006,307원 - 903,038,723원 - 155,529,000원)으로 조사되었다’는 이 유로, 2006년 귀속 양도소득세 299,442,550원을 경정 · 고지(이하 ’이 사건 처분’이라 한다) 하였다.

[인정근거] 다툼 없는 사실, 갑 1, 2, 5, 7호증, 을 1, 2호증의 각 기재, 변론 전체의취지

2. 이 사건 처분의 적법 여부

가. 원고의 주장

원고는, ① 2006. 12.경 EE환경에게 이 사건 쟁점토지를 13억 9,000만 원에, 별지 부동산 목록 3. 내지 6. 기재 각 토지를 1억 1,000만 원에 각 양도하고, EE환경으 로부터 15억 원을 지급받았으므로, 이 사건 쟁점토지의 양도가액은 13억 9,000만 원 이고,② 설사, 이 사건 계약을 기준으로 이 사건 쟁점토지의 양도가액을 정하더라도, EE환경이 BB기계로부터 실제로 지급받은 35억 5,000만 원 중 5억 원은 EE환경 양도에 대한 권리금이고, 15억 원은 EE환경 주식대금이며, 15억 원은 이 사건 각 토지대금이고, 5,000만 원은 별지 부동산 목록 7. 기재 토지대금이므로, 이 경우에도 이 사건 쟁점토지의 양도가액은 13억 9,000만 원이다. 그럼에도, 피고가 이 사건 쟁점토지의 양도가액을 2,013,006,000원으로 산정하여 양도소득세를 경정·고지한 이 사건 처분은 위법하므로, 취소되어야 한다.

나. 관계법령

별지 관계법령 기재와 같다.

다. 인정사실

1) EE환경의 설립 및 주주변경

가) EE환경은 2004. 2. 12. 이 사건 쟁점토지 등의 지상에 건설폐기물중간처리 및 제조재활용품 골재생산 등을 목적으로 자본금 15억 원(150,000주, 액면가 1만원), 박KK을 대표자로 설립되었고, 대표자가 2004. 8. 13. 김GG로, 2007. 1. 1. 박FF로 각 변경되었다.

  

나) 이 사건 계약 전·후 EE환경의 주주변동내역은 아래와 같은데, 김GG은 원고의 배우자(남편)이고, 김HH과 김JJ는 원고의 아들이다.

2) EE환경과 BB기계 간의 포괄적 양도·양수가) 이 사건 계약의 주요내용은 아래와 같다.

나) BB기계에 대한 EE환경의 대표이사 김HH, 주주 겸 이사 김GG, 김JJ의 2006. 12. 29.자 ’주식회사 EE환경산업 사업 및 사업장부지 대금완납확인서’에는 아래와 같이 기재되어 있다.

다) 국세통합시스템 자료에 의하면, EE환경은 사업양도·양수일(2007.1. 1.) 현재 이 사건 계약에서 약정한 자산 중 인계대상 매출채권과 유동자산은 없고, EE환경의 2005년 사업연도 대차대조표 기준 고정자산은 김해시 OO리 000-0 및 같은 리 000-0 토지 2필지 105,105,600원, EE환경과 BB기계가 별도계약 하기로 한 장비 및 차량을 제외한 나머지 기계장치 등 기타자산 1,425,766,040원, 부채 950,000,000원으로 순자산가액은 580,871,640원(= 105,105,600원 + 1,425,766,040원 - 950,000,000원)이다.

라) EE환경의 2005년 법인세과세표준 및 세액신고서에 첨부된 표준대차대조표 상 EE환경 주식 1주당 가액은 10,000원, 총 주식가액 15억 원(= 10,000원 x 150,000 주) 정도이고, 2006년 귀속 EE환경의 ’법인세과세표준 및 세액신고서’의 표준대차대 조표상 유형자산 중 토지의 장부 계상액은 1,524,105,000원이며, EE환경은 2006. 12. 19. EE환경의 자본금을 15억 원에서 30억 원으로 증자하였다.

마) 원고 등 EE환경의 종전 주주들은 피고에게 BB기계 등에게 주식 전부를 액면가에 양도하여 양도차익이 없는 것으로 양도소득세 확정신고를 하였다.

바) EE환경은 2006. 12.경 12월 급여로 50,544,890원, 퇴직금 및 위로금으로 236,194,218원, 대표이사 가수금 변제에 63,805,782원, 미지급 경비 등으로 302,135,243원 합계 652,680,133원(50,544,890원 + 236,194,218원 + 63,805,782원 + 302,135,243원)을 지출하였다.

3) 이 사건 각 토지의 양도 및 취득

가) 이 사건 쟁점토지의 취득가액은 903,038,723원이고, 필요경비는 155,529,000 원이다.

나) 이 사건 쟁점토지 중 별지 부동산 목록 1. 기재 토지의 매매계약서에는 ”매매대금 : 10억 5,000만 원, 계약금 : 1억 5,000만 원(영수함), 잔금 : 9억 원, 2006. 12. 25. 지급함”으로, 별지 부동산 목록 2. 기재 토지의 매매계약서에는 ”매매대금 : 3억

  

4,000만 원(영수함)"으로 각 기재되어 있다.

다) 이 사건 쟁점토지의 평균감정가액(감정평가법인 : ○○○감정평가법인, △△감정평가법인), 별지 목록 기재 각 토지에 대한 원고 및 피고 주장 매매금액 및 2006 년과 2007년의 기준시가는 아래와 같다.

라) 원고는 BB기계로부터, 2006. 12. 4. 3억원, 2006. 12. 15. 2억 원 합계 5억원을 지급받았고, EE환경으로부터, 2006. 12. 20. 1억 8,200만 원, 같은 달 22. 10억 800만원 합계 11억 9,000만 원을 지급받았으며, 보증금반환채무 3억 원과 이 사건 각 토지 대금 중 일부를 상계하였고, 같은 날 EE환경의 대표이사 김HH에게 3억 원을 송금하였다.

마) 한편, 이 사건 각 토지 중 별지 부동산 목록 3. 내지 6. 기재 각 토지에 관한 부동산등기부등본 또는 매매계약서에는, 원고가 2006. 12. 29. EE환경에게 별지 부동산 목록 3, 6 기재 각 토지를 2,900만 원에, 2007. 6. 27. 별지 부동산 목록 5. 기재 토지를 400만 원에에 각 양도하고, 같은 날 박FF에게 별지 부동산 목록 4. 기재 토지를 500만 원에 양도한 것으로 기재되어 있다.

4) 별지 부동산 목록 7. 기재 토지의 양도 및 취득

가) 김HH 소유였던 별지 부동산 목록 7. 기재 토지의 등기부등본에는 ”등기목적 : 소유권이전, 접수 : 2006. 12. 29. 제116438호, 등기원인 : 2006. 12. 28. 매매, 권리자 및 기타사항 : 소유자 박FF, 거래가액 금29,000,000원”으로 기재되어 있고, 원고가 매매계약일이 2006. 12. 28.임에도 착오로 2006. 11. 28.로 잘못 기재되었다고 주장하는 부동산매매계약서에는 ”매매대금 : 5,000만 원(영수함)"으로, 검통관이 2007. 2.경 실지 거래가액에 의한 양도소득세를 신고하면서 제출한 부동산매매계약서에는 ”매매대금 : 29,000,000원, 2006. 8. 28."로 각 기재되어 있다.

나) EE환경은 2006. 12. 29. 김HH에게 2,900만 원을 송금하였다.

5) BB기계 대표이사 박FF의 문답서, 확인서 및 증언

가) 이 사건 쟁점토지에 대한 2009. 11. 27.자 박FF 문답서의 주요내용은 아래와 같다.

나) 박FF의 2009. 12. 7.자 부동산 실거래가액 확인서에는 ”사업장 부지 매매 금액은 15억 원임을 확인한다”고 기재되어 있고, 2010. 4. 30.자 확인서에는 ”계약금 5 억원은 EE환경의 사업을 포괄적으로 인수하기 위한 영업권(권리금)임을 확인한다”고 기재되어 있다.

다) 박FF는 2011. 8. 25. 법정에서 아래와 같이 증언하였다.

[인정근거] 다툼 없는 사실, 갑 1 내지 4, 6 내지 15호증, 을 1 내지 12호증의 각 기 재, 증인 박FF의 일부 증언, 변론 전체의 취지

라.판단 

1) 가. ⁠(1) 주장에 관한 판단

국세기본법 제14조 제2항은 ”세법 중 과세표준의 계산에 관한 규정은 소득·수익·재산·행위 또는 거래의 명칭이나 형식에 관계없이 그 실질내용에 따라 적용한다”고 규정하고 있다. 이 사건에 관하여 보건대, 위 인정사실 및 변론 전체의 취지에 의하여 인정되는 다음과 같은 사정, 즉 ① 원고의 남편인 김GG이 이 사건 계약 당시(2006.12.1.) II기계와 EE환경의 사업과 자산 뿐만 아니라 원고 소유의 이 사건 각 토지를 양도하 는 계약을 체결하였고, BB기계 대표이사인 박FF가 김GG이 지정하는 사람에게 지정한 액수를 송금한 점,② 원고와 원고의 가족들이 2006. 10. 16. 기준으로 EE환경의 주식 150,000주 중 145,000주(96.7%)를, 위 계약 당시 기준으로 주식 150,000주 중 74,500주(49.7%)를 각 보유하고 있었던 점,③ 이 사건 쟁점토지에 대한 평균감정가액 ⁠(2006.12.18.기준)이 1,374,647,000원이고, 이 사건 쟁점토지의 매매계약서상 양도가액이 13억 9,000만 원이기는 하나, 위 13억 9,000만 원은 2006년 기준시가 대비 68.5%( = 1,390,000,000원 ÷ 2,029,676,000원), 2007년 기준시가대비 .. 58.1%(= 1,390,000,000원 ÷ 2,391,783,000원)에 불과한 점,④ EE환경의 주식 전부가 BB기계에게 양도된 2006. 12. 18. 이후인 2006. 12. 20.에 이르러 원고가 EE환경에게 이 사건 쟁점토지를 양도한 점,⑤ 원고는 BB기계로부터 5억 원, EE환경으로부터 11 억 9,000만 원, 보증금반환채무와 상계한 3억 원 합계 19억 9,000만 원(주식 대금 2억 원 포함)을 지급받아 이 사건 각 부동산의 매매대금으로 17억 9,000만 원(=19억 9,000 만 원 - 2억 원)을 수령하였다가 2006. 12. 26.에서야 EE환경 대표이사에게 3억 원을 송금한 점 ,⑥ 원고는 2006. 12. 20., 같은 달 29. 및 2007. 6. 27. EE환경 또는 박DD에게 이 사건 각 토지를 순차적으로 양도하였고, 각 매매계약서도 위 각 양도일 무렵 작성된 것으로 보이며, 각 매매계약서상 매매가액의 합계가 14억 2,800만 원(= 13 억 9,000만 원 + 2,900만원 + 400만 원 + 500만 원)으로서 원고가 주장하는 15억 원에 미달되는 등 이 사건 쟁점토지에 관한 2006. 12. 20.자 매매계약서를 실제 매매계약서로 보기 어려운 점 등을 종합해보면, 원고의 남편인 김GG이 2006. 12. 1. 원고를 대신하여 BB기계에게 원고 소유의 이 사건 각 토지를 매도하고 편의상 EE환경 명의로 소유권이전등기를 마쳤으며, 원고 또는 EE환경이 BB기계로부터 그 매매대금을 지급받았다고 봄이 상당하므로, 원고의 위 주장은 이유 없다.

2) 가.(2) 주장에 관한 판단

먼저, 원고가 주장하는 권리금 5억 원에 관하여 보건대, 위 인정사실 및 변론 전체의 취지에 의하여 인정되는 다음과 같은 사정, 즉 ① 통상 주식 전부를 인수하는 방식으로 사업을 포괄양도·양수하는 경우에는 유형자산과 영업권, 허가권 등의 무형자산을 합산하여 그 주식대금을 산정하게 되는데, 2005년도 표준대차대조표에 의한 EE환경의 총 주식가액은 15억 원 정도이고, BB기계도 그 주식 전부를 15억 원에 인수하였으며, 원고 등 EE환경의 종전 주주들이 주식양도로 인한 양도차익이 없다고 양도소득세 확정신고를 한 점,② 포괄양도·양수의 대상이 된 EE환경의 순자산가액이 2005년 대차대조표상 580,871,640원에 불과하고, EE환경이 위 양도·양수 당시 사실상 적자 회사로서, 총 주식가액 15억 원은 위 순자산가액과 권리금, 영업권 등 무형자산을 합산한 금액으로 보이는 점,③ 박FF가 포괄양도·양수대금 45억 원 중 주식대금 15억원을 제외한 나머지는 부동산 매매대금이라고 진술하기도 한 점 등을 종합해 보면, 원고가 권리금으로 주장하는 5억 원은 권리금이 아니라 이 사건 각 토지의 매매 대금 중 일부로 봄이 상당하므로, 원고의 위 주장도 이유 없다. 다음으로, 원고가 주장하는 별지 부동산 목록 7. 기재 토지대금 5,000만 원에 관하여 보건대, 위 인정사실 및 변론 전체의 취지에 의하여 인정되는 다음과 같은 사정, 즉 ① 포괄양도·양수 대상을 기재한 이 사건 계약서의 별도표시 1 주요자산총액에 위 토지가 포함되어 있지 아니한 점,② 위 토지에 관한 부동산등기부 등본에 위 토지의 거래가액이 2,900만 원으로 기재되어 있고, 실제로 김HH이 EE환경으로부터 토지대금으로 2,900만 원을 지급받았으며, 양도소득세도 2,900만 원을 신고·납부하였던 점 등을 종합해 보면, 원고가 위 35억 5,000만 원에 포함되어 있다고 주장하는 별지 목록 7. 기재 토지 양도대금 5,000만 원은 위 35억 5,000만 원에 포함되어 있는 것으로 볼 수 없고, 이 사건 각 토지의 매매대금 중 일부로 봄이 상당하므로, 원고의 위 주장도 이유 없다.

3) 소결

따라서, 이 사건 쟁점토지의 양도가액은 이 사건 각 토지의 양도가액 20억 5,000만 원을 2006년도 기준시가에 따라 안분한 2,029,676,000원이므로(구 소득세법 제100조 제2항, 구 소득세법 시행령 제166조 제4항, 부가가치세법 시행령 제48조의2 제4항 참조), 이와 같은 전제에서 피고가 한 이 사건 처분은 적법하다.

3. 결론

그렇다면, 원고의 청구는 이유 없으므로, 이를 기각한다.

출처 : 창원지방법원 2012. 01. 19. 선고 창원지방법원 2011구합1090 판결 | 국세법령정보시스템