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공익사업 토지수용 보상금 증액시 양도소득세 수정신고 가산세 여부

부동산납세과-269  ·  2014. 04. 17.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 공익사업 토지수용 후 보상금이 이의신청 등으로 증액된 경우, 증액분에 대해 양도소득세 수정신고 및 가산세 적용 여부는 어떻게 되는지요?

S요약

거주자가 소유한 토지가 공익사업법에 따라 수용되어 소유권이전등기 후 보상금이 이의신청 등으로 증액된 경우, 증액된 보상금에 대한 양도소득세국세기본법 제45조에 따라 수정신고해야 하며, 수령월 말일부터 2개월 이내 신고·납부시 가산세가 적용되지 않는 것으로 판단됩니다.
#토지 수용 #보상금 증액 #양도소득세 #수정신고 #가산세 #국세기본법
핵심 정리

R회신 내용 부동산납세과-269  ·  2014. 04. 17.

  • 회신 주체: 국세청 부동산납세과-269(2014.04.17)
  • 토지가 공익사업법 등 관련 법률에 따라 공공사업을 위해 수용될 때, 소유권이전등기 후에도 이의신청 등으로 인해 보상금이 추가로 증액되는 경우가 있습니다.
  • 증액된 보상금은 기존 양도소득과세표준 신고 후에도 국세기본법 제45조에 근거하여 수정신고해야 합니다.
  • 납세자는 증액된 보상금의 수령일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내에 과세표준수정신고서를 제출하고 추가 자진납부를 하면 국세기본법 제48조 제1항에 따라 신고·납부불성실가산세가 적용되지 않습니다.
  • 관련 유사사례와 실무 지침에서도 이러한 절차와 해석이 반복적으로 확인되고 있습니다.

L관련 법령 해석

  • 소득세법 제98조: 자산의 양도차익 계산 시 양도시기는 대금을 청산한 날이 원칙
  • 소득세법 시행령 제162조: 공익사업 등에 의한 수용의 경우, 대금청산일·수용개시일·등기접수일 중 빠른 날이 양도시기
  • 국세기본법 제45조: 과세표준신고 후 보상금 증액 등 사유 발생 시 수정신고 가능
  • 국세기본법 제48조: 신고·납부불성실가산세는 증액된 보상금 수령월 말일부터 2개월 이내 신고·납부 시 적용하지 않음
사례 Q&A
1. 공익사업 토지수용 후 보상금이 증액되면 양도세는 어떻게 신고해야 하나요?
답변
증액된 보상금에 대해서는 별도로 과세표준수정신고를 하셔야 합니다.
근거
국세기본법 제45조에 따라 추가된 금액을 신고하는 절차가 규정되어 있습니다.
2. 증액된 보상금 신고시 가산세가 면제되는 조건이 있나요?
답변
증액분 수령월 말일부터 2개월 이내에 수정신고 및 자진납부를 하면 신고·납부불성실가산세가 적용되지 않습니다.
근거
국세기본법 제48조는 기한 내 신고·납부시 가산세를 부과하지 않는다고 명시합니다.
3. 토지수용 보상금 증액이 확정되면 언제까지 신고해야 하나요?
답변
증액된 보상금 수령일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내에 과세표준수정신고서를 제출하셔야 합니다.
근거
국세기본법 제45조 및 제48조에 따른 신고 기한 규정이 적용됩니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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유권해석 전문

요지

거주자가 소유하는 토지가 ⁠「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」에 따른 공공사업의 시행자에게 수용되어 사업시행자 명의로 소유권이전등기하고, 수용개시일을 기준으로 법정신고기한까지 양도소득과세표준신고서를 제출한 이후 토지 보상가액이 증액된 경우, 해당 증액된 보상금은 ⁠「국세기본법」제45조에 따라 수정신고하여야 하는 것임

회신

1. 부동산의 양도시기는 원칙적으로 해당 자산의 대금을 청산한 날(대금을 청산하기 전에 소유권이전등기를 한 경우에는 등기접수일)이 되는 것이며, ⁠「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」이나 그 밖의 법률에 따라 공익사업을 위하여 수용되는 경우에는 대금을 청산한 날, 수용의 개시일 또는 소유권이전등기접수일 중 빠른 날이 되는 것입니다.

2. 거주자가 소유하는 토지가 ⁠「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」에 따른 공공사업의 시행자에게 수용되어 수용개시일을 기준으로 법정신고기한까지 양도소득과세표준신고서를 제출한 이후 토지 보상가액에 대한 이의신청으로 보상금이 증액된 경우, 해당 증액된 보상금은 ⁠「국세기본법」제45조에 따라 수정신고하여야 하는 것이며, 납세자가 증액된 보상금의 수령일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내에 과세표준수정신고서를 제출하고 동시에 추가자진납부하는 경우 ⁠「국세기본법」제48조제1항에 따라 신고․납부불성실가산세가 적용되지 아니하는 것입니다.

※ 관련참고자료

1. 질의내용 요약

○ 사실관계

 - 1999.09.10 경기 ○○시 ○○구 소재 부동산 취득

    - 2013.12.20 수용시 재결보상금에 대한 이의를 유보하고 보상금 수령

        * 이의재결 신청중

    - 2014.01.14 수용개시

    - 2014.02.10 소유권이전 등기접수

○ 질의내용

      토지 수용 보상금에 관한 이의재결신청에 따라 변동보상금 수령시 양도시기 및 증액된 보상금에 관한 양도소득세 수정신고시 가산세 여부

2. 질의내용에 대한 자료

 가. 관련 조세 법령 ⁠(법률, 시행령, 시행규칙, 기본통칙)

   소득세법 제94조 【양도소득의 범위】

     ① 양도소득은 해당 과세기간에 발생한 다음 각 호의 소득으로 한다.

     1. 토지[「측량ㆍ수로조사 및 지적에 관한 법률」에 따라 지적공부(地籍公簿)에 등록하여야 할 지목에 해당하는 것을 말한다] 또는 건물(건물에 부속된 시설물과 구축물을 포함한다)의 양도로 발생하는 소득

     2. 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 부동산에 관한 권리의 양도로 발생하는 소득

     가. 부동산을 취득할 수 있는 권리(건물이 완성되는 때에 그 건물과 이에 딸린 토지를 취득할 수 있는 권리를 포함한다)

     나. 지상권

     다. 전세권과 등기된 부동산임차권

   소득세법 제98조 【양도 또는 취득의 시기】

    자산의 양도차익을 계산할 때 그 취득시기 및 양도시기는 대금을 청산한 날이 분명하지 아니한 경우 등 대통령령으로 정하는 경우를 제외하고는 해당 자산의 대금을 청산한 날로 한다. 이 경우 자산의 대금에는 해당 자산의 양도에 대한 양도소득세 및 양도소득세의 부가세액을 양수자가 부담하기로 약정한 경우에는 해당 양도소득세 및 양도소득세의 부가세액은 제외한다.

    소득세법 제105조 【양도소득과세표준 예정신고】

     ① 제94조제1항 각 호에서 규정하는 자산을 양도한 거주자는 제92조제2항에 따라 계산한 양도소득과세표준을 다음 각 호의 구분에 따른 기간에 대통령령으로 정하는 바에 따라 납세지 관할 세무서장에게 신고하여야 한다.

     1. 제94조제1항제1호ㆍ제2호 및 제4호에 따른 자산을 양도한 경우에는 그 양도일이 속하는 달의 말일부터 2개월. 다만, 「국토의 계획 및 이용에 관한 법률」 제117조제1항에 따른 토지거래계약에 관한 허가구역에 있는 토지를 양도할 때 토지거래계약허가를 받기 전에 대금을 청산한 경우에는 그 허가일이 속하는 달의 말일부터 2개월로 한다.

     2. 제94조제1항제3호 각 목에 따른 자산을 양도한 경우에는 그 양도일이 속하는 분기의 말일부터 2개월

     ② 제1항에 따른 양도소득 과세표준의 신고를 예정신고라 한다.

     ③ 제1항은 양도차익이 없거나 양도차손이 발생한 경우에도 적용한다.

    ○ 소득세법 시행령 제162조 【양도 또는 취득의 시기】

     ① 법 제98조 전단에서 "대금을 청산한 날이 분명하지 아니한 경우 등 대통령령으로 정하는 경우"란 다음 각 호의 경우를 말한다.

      1. ~ 6. 생략

      7. ⁠「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」이나 그 밖의 법률에 따라 공익사업을 위하여 수용되는 경우에는 대금을 청산한 날, 수용의 개시일 또는 소유권이전등기접수일 중 빠른 날

    ○ 국세기본법 제45조 【수정신고】

      ① 과세표준신고서를 법정신고기한까지 제출한 자(「소득세법」 제73조제1항제1호부터 제7호까지의 어느 하나에 해당하는 자를 포함한다)는 다음 각 호의 어느 하나에 해당할 때에는 관할 세무서장이 각 세법에 따라 해당 국세의 과세표준과 세액을 결정 또는 경정하여 통지하기 전으로서 제26조의2제1항에 따른 기간이 끝나기 전까지 과세표준수정신고서를 제출할 수 있다.

      1. 과세표준신고서에 기재된 과세표준 및 세액이 세법에 따라 신고하여야 할 과세표준 및 세액에 미치지 못할 때

      2. 과세표준신고서에 기재된 결손금액 또는 환급세액이 세법에 따라 신고하여야 할 결손금액이나 환급세액을 초과할 때

      3. 제1호 및 제2호 외에 원천징수의무자의 정산 과정에서의 누락, 세무조정 과정에서의 누락 등 대통령령으로 정하는 사유로 불완전한 신고를 하였을 때(제45조의2에 따라 경정 등의 청구를 할 수 있는 경우는 제외한다)

      ② 삭제

      ③ 과세표준수정신고서의 기재사항 및 신고 절차에 관한 사항은 대통령령으로 정한다.

    ○ 국세기본법 제48조 【가산세 감면 등】

      ① 정부는 이 법 또는 세법에 따라 가산세를 부과하는 경우 그 부과의 원인이 되는 사유가 제6조제1항에 따른 기한연장 사유에 해당하거나 납세자가 의무를 이행하지 아니한 데 대한 정당한 사유가 있는 때에는 해당 가산세를 부과하지 아니한다.

      ② 정부는 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 이 법 또는 세법에 따른 해당 가산세액에서 다음 각 호에서 정하는 금액을 감면한다.

      1. 법정신고기한이 지난 후 제45조에 따라 수정신고한 경우(제47조의3에 따른 가산세만 해당하며, 과세표준과 세액을 경정할 것을 미리 알고 과세표준수정신고서를 제출한 경우는 제외한다)에는 다음 각 목의 구분에 따른 금액

      가. 법정신고기한이 지난 후 6개월 이내에 수정신고한 경우: 해당 가산세액의 100분의 50에 상당하는 금액

      나. 법정신고기한이 지난 후 6개월 초과 1년 이내에 수정신고한 경우: 해당 가산세액의 100분의 20에 상당하는 금액

      다. 법정신고기한이 지난 후 1년 초과 2년 이내에 수정신고한 경우: 해당 가산세액의 100

 나. 유사사례 ⁠(판례, 심판례, 심사례, 예규)

    ○ 부동산거래관리과-1061(2011.12.21)

   귀 질의의 경우 거주자가 소유하는 토지가 2010.1.1. 이후 ⁠「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」에 따른 공공사업의 시행자에게 수용되어 사업시행자 명의로 소유권이전등기하고, 소유권이전등기일을 기준으로 법정신고기한까지 양도소득과세표준신고서를 제출한 이후 토지 보상가액에 대한 소송에 의하여 보상금이 증액된 경우, 해당 증액된 보상금은 ⁠「국세기본법」제45조에 따라 수정신고하여야 하는 것이며, 납세자가 증액된 보상금의 수령일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내에 과세표준수정신고서를 제출하고 동시에 추가자진납부하는 경우 ⁠「국세기본법」제48조제1항에 따라 신고·납부불성실가산세가 적용되지 아니하는 것입니다.

    ○ 부동산거래관리과-34 ⁠(2013.01.23)

    1.「공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률」이나 그 밖의 법률에 따라 공익사업을 위하여 토지가 수용되는 경우 해당 토지의 양도시기는 대금을 청산한 날, 수용의 개시일 또는 소유권이전등기접수일 중 빠른 날입니다.

    2. 귀 질의의 경우 토지의 양도시기를 판단할 때 ⁠‘대금을 청산한 날’은 재결보상금을 이의없이 수령한 경우에는 보상금수령일이고, 재결에 불복하여 이의신청 또는 행정소송으로 변동된 보상금을 수령하는 경우에는 해당 변동 보상금 확정일입니다.

출처 : 국세청 2014. 04. 17. 부동산납세과-269 | 국세법령정보시스템