시장정비사업 추진 위한 주식인수 컨설팅비 매입세액 공제 인정 여부

2010두12552
판결 요약
시장정비사업을 추진하던 회사가 사업구역 내 토지를 대부분 소유한 회사의 주식인수를 위해 지급한 컨설팅대금에 대한 부가가치세 매입세액 공제를 신청하자, 과세관청은 이를 사업과 직접 관련 없는 지출이라며 불공제 처리하였습니다. 대법원은 부가가치세 공제 기준은 사업 관련성에 있고, 관련성은 지출 목적·경위·사업 내용에 따라 개별적으로 판단해야 한다고 전제하면서, 시장정비사업을 위해서는 해당 회사 주식의 인수가 필수적이었고, 그를 위한 컨설팅비는 사업 수행에 필요한 지출이므로 매입세액 공제가 가능하다고 보았습니다. 또한 이 사건 용역대금은 토지의 취득·형질변경 등 토지 관련 매입세액에도 해당하지 않는다고 판단하였습니다.
#부가가치세 매입세액 공제 #사업과 직접 관련 없는 지출 #사업 관련성 판단 기준 #시장정비사업 부가세 #주식인수 컨설팅 비용
질의 응답
1. 부가가치세 매입세액 공제가 가능한 ‘사업 관련 지출’인지 어떻게 판단하나요?
답변
부가가치세 매입세액 공제 여부는 지출이 ‘자기의 사업을 위하여 사용되었거나 사용될’ 것인지, 즉 사업 수행에 필요했는지를 기준으로 개별 판단됩니다. 지출의 목적·경위·사업 내용 등을 종합해 보아 해당 비용이 사업을 실제로 추진·수행하는 데 필요했다면, 원칙적으로 매출세액에서 공제되는 매입세액에 해당할 수 있습니다. 반대로 사업 수행과 무관하거나 사적·투기적 성격의 지출은 사업과 직접 관련이 없는 지출로 보아 공제가 배제될 가능성이 높습니다.
근거
대법원 2012. 7. 26. 선고 2010두12552 판결은 구 부가가치세법 제17조 제1항, 제2항 제2호의 매입세액 공제는 사업 관련성을 기준으로 하고, 지출의 목적·경위·사업 내용에 비추어 사업 수행에 필요한지를 개별적으로 판단해야 한다고 판시하였습니다.
2. 시장정비사업을 위해 상대 회사 주식을 인수하면서 지급한 컨설팅비도 부가세 매입세액 공제가 되나요?
답변
시장정비사업을 실질적으로 추진하기 위해 상대 회사 주식을 인수할 필요가 있고, 해당 컨설팅비가 그 주식인수를 위한 필수적 자문·조정 비용이라면, 이는 시장정비사업 수행에 필요한 지출로 보아 사업 관련성이 인정될 수 있습니다. 이 경우 그 컨설팅비에 포함된 부가가치세는 ‘사업과 직접 관련이 없는 지출’에 대한 매입세액에 해당하지 않아 공제가 허용될 여지가 큽니다.
근거
대법원 2010두12552 판결은 시장정비사업구역 내 토지 대부분을 소유한 회사를 인수하기 위한 주식인수 컨설팅대금에 대해, 사업을 시행하려면 그 회사 주식 인수가 필요했으므로 해당 지출은 시장정비사업 수행에 필요한 지출이라 보았습니다. 따라서 그 매입세액은 구 부가가치세법 제17조 제1항, 제2항 제2호의 불공제대상 매입세액이 아니라고 하였습니다.
3. 개발사업에서 상대 토지 소유회사의 경영권 확보 비용은 ‘사업과 직접 관련 없는 지출’에 해당하나요?
답변
개발사업을 추진하기 위해 특정 회사가 소유한 토지의 지배를 확보하는 것이 사실상 필수 전제라면, 그 회사 주식·지분 확보를 위한 컨설팅 등 비용은 단순한 경영권 취득이나 투자 목적이 아니라 개발사업 수행을 위한 필요 비용으로 볼 수 있습니다. 이 경우 해당 비용은 구 부가가치세법상 사업과 직접 관련이 없는 지출으로 보기 어렵고, 매입세액 공제 대상이 될 가능성이 있습니다.
근거
대법원 2010두12552 판결은 사업구역 내 토지의 약 75%를 소유한 회사의 주식 인수 없이는 시장정비사업 추진이 곤란한 상황에서, 그 주식인수를 위한 컨설팅비는 지배적 지위 확보·수익 증대만을 위한 비용에 그치는 것이 아니라 사업 수행에 필요한 지출이라고 보고, 이를 ‘사업과 직접 관련 없는 지출’에 포함시킨 원심을 위법하다고 판단하였습니다.
4. 시장정비사업 관련 용역비가 ‘토지 관련 매입세액’으로 보이면 부가세 공제가 안 되나요?
답변
구 부가가치세법 제17조 제2항 제4호 및 시행령은 토지의 취득·형질변경·조성 등 토지의 가치를 현실적으로 증가시키는 자본적 지출에 관련된 매입세액은 공제하지 못하도록 규정하고 있습니다. 그러나 개발사업 업무대행, 인허가 절차 진행 등과 같은 사업 시행 일반에 관한 용역으로서 토지 취득원가를 직접 증가시키지 않는 비용이라면, 토지 관련 매입세액으로 보지 않아 공제가 허용될 수 있습니다.
근거
대법원 2010두12552 판결은 시장정비사업 시행을 위한 업무대행용역에 대한 매입세액이 구 부가가치세법 제17조 제2항 제4호, 시행령 제60조 제6항이 정한 토지의 취득·형질변경 등 토지 관련 매입세액에 해당하지 않는다고 보아, 이를 토지 관련 불공제 매입세액으로 본 과세관청의 주장을 배척하였습니다.
5. 부가세 공제를 받으려면 주식인수나 컨설팅비의 사업 관련성을 어떻게 입증해야 하나요?
답변
주식인수·컨설팅비가 공제 대상이 되려면, 해당 지출이 특정 사업을 추진하기 위한 필수 수단이었음을 보여주는 자료를 확보해 두시는 것이 좋습니다. 예를 들어 사업구역 내 토지 소유 구조, 상대 회사 지분 구조와 의사결정 방식, 사업 추진을 위해 그 회사 지분 확보가 필요했던 사정, 컨설팅 계약서와 수행 내역 등에서 구체적인 사업 목적 및 필요성이 드러나야 합니다. 이러한 자료가 있을수록 과세관청이 ‘사업과 직접 관련 없는 지출’이라고 보기 어렵습니다.
근거
대법원 2010두12552 판결은 사업구역 내 토지의 대부분을 특정 회사가 소유하고 있었던 점, 다수 주주와 임대·전대 관계 등 복잡한 이해관계, 주식 인수 후 공동사업약정 체결 및 주식 추가 인수 경위 등을 근거로, 해당 컨설팅비가 시장정비사업을 추진하기 위한 필요 지출이라고 보았습니다.

* 본 법률정보는 대법원 판결문을 바탕으로 한 일반적인 정보 제공에 불과하며, 구체적인 사건에 대한 법률적 판단이나 조언으로 해석될 수 없습니다.

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판결 전문

부가가치세부과처분등취소

 ⁠[대법원 2012. 7. 26. 선고 2010두12552 판결]

【판시사항】

[1]
구 부가가치세법 제17조 제1항,
제2항 제2호에서 정한 매출세액에서 공제하는 매입세액의 기준인 ⁠‘사업 관련성’ 유무의 판단 기준

[2] 甲 주식회사가 시장정비사업을 추진하면서 사업구역 내 토지의 대부분을 소유한 乙 주식회사의 주식인수를 위해 지출한 컨설팅대금에 대한 매입세액을 공제하여 부가가치세 환급신청을 하였는데, 과세관청이
구 부가가치세법 제17조 제2항 제2호에서 정한 ⁠‘사업과 직접 관련이 없는 지출에 대한 매입세액’에 해당한다는 이유로 거부한 사안에서, 제반 사정에 비추어 컨설팅대금 지출에 사업 관련성이 있고, 그에 대한 매입세액은이 위 규정상 불공제대상 매입세액에 해당하지 않는다는 이유로, 이와 달리 본 원심판결에 법리오해의 위법이 있다고 한 사례

【판결요지】

[1] 현행 부가가치세 과세방법은 원칙적으로 사업자의 자기생산 부가가치에 대해서만 과세가 이루어지도록 하기 위하여 납부세액 산출방식에 있어 자기생산 부가가치와 매입 부가가치를 합한 금액을 공급가액으로 하고, 이에 대하여 징수할 매출세액에서 매입 부가가치에 대하여 지출된 매입세액을 공제하도록 하는 기본적 구조를 채택하고 있다. 이러한 구조하에서
구 부가가치세법(2010. 1. 1. 법률 제9915호로 개정되기 전의 것, 이하 ⁠‘법’이라 한다) 제17조는 매출세액에서 공제하는 매입세액에 관하여
제1항에서 ⁠‘자기의 사업을 위하여 사용되었거나 사용될’ 재화 또는 용역의 공급이나 수입에 대한 세액에 해당하는 이상 그 전부를 공제하도록 규정함으로써 그 기준을 사업 관련성에 두고 있으며,
같은 조 제2항 제2호에서 공제하지 아니하는 매입세액의 하나로 들고 있는 ⁠‘사업과 직접 관련이 없는 지출에 대한 매입세액’은 부가가치세의 원리상 당연히 매출세액에서 공제될 수 없는 경우를 규정하고 있는 것으로 이해된다. 따라서 사업 관련성이 없는 지출에 대한 매입세액은
법 제17조 제1항,
제2항 제2호에 의하여 매출세액에서 공제될 수 없고, 여기에서 사업 관련성의 유무는 지출의 목적과 경위, 사업의 내용 등에 비추어 그 지출이 사업의 수행에 필요한 것이었는지를 살펴 개별적으로 판단하여야 한다.

[2] 甲 주식회사가 시장정비사업을 추진하면서 사업구역 내 토지의 대부분을 소유한 乙 주식회사의 주식인수를 위해 지출한 컨설팅대금 25억 원에 대한 매입세액을 공제하여 부가가치세 환급신청을 하였는데, 과세관청이 위 매입세액이
구 부가가치세법(2010. 1. 1. 법률 제9915호로 개정되기 전의 것, 이하 ⁠‘법’이라 한다) 제17조 제2항 제2호에서 정한 ⁠‘사업과 직접 관련이 없는 지출에 대한 매입세액’에 해당한다는 이유로 거부한 사안에서, 제반 사정에 비추어 甲 회사가 시장정비사업을 추진하기 위해서는 사업구역 내 토지의 대부분을 소유한 乙 회사를 인수할 필요가 있어 그 주식인수를 위한 컨설팅대금 지출은 위 사업에 필요한 것으로서 사업 관련성이 있으므로, 그에 대한 매입세액은
법 제17조 제1항,
제2항 제2호에서 정한 불공제대상 매입세액에 해당하지 않는다는 이유로, 이와 달리 본 원심판결에 법리오해의 위법이 있다고 한 사례.

【참조조문】

[1]
구 부가가치세법(2010. 1. 1. 법률 제9915호로 개정되기 전의 것) 제17조 제1항,
제2항 제2호(현행
제17조 제2항 제3호 참조)
[2]
구 부가가치세법(2010. 1. 1. 법률 제9915호로 개정되기 전의 것) 제17조 제1항,
제2항 제2호(현행
제17조 제2항 제3호 참조)

【참조판례】

[1]
대법원 1995. 12. 21. 선고 94누1449 전원합의체 판결(1996상, 283)


【전문】

【원고, 피상고인 겸 상고인】

주식회사 동언 ⁠(소송대리인 법무법인 케이씨엘 담당변호사 최종길 외 2인)

【피고, 상고인 겸 피상고인】

동대문세무서장

【원심판결】

서울고법 2010. 5. 27. 선고 2009누25394 판결

【주 문】

원심판결 중 원고 패소 부분을 파기하고, 이 부분 사건을 서울고등법원에 환송한다. 피고의 상고를 기각한다.

【이 유】

상고이유를 판단한다. 
1.  원고의 상고이유에 대하여 
가.  구 부가가치세법(2010. 1. 1. 법률 제9915호로 개정되기 전의 것, 이하 ⁠‘법’이라 한다) 제17조 제1항은 사업자가 납부하여야 할 부가가치세액은 ⁠‘자기가 공급한 재화 또는 용역에 대한 세액(매출세액)에서 자기의 사업을 위하여 사용되었거나 사용될 재화 또는 용역의 공급 및 재화의 수입에 대한 세액(매입세액)을 공제한 금액’으로 하도록 규정하고, 같은 조 제2항 제2호는 매출세액에서 공제하지 아니하는 매입세액의 하나로 ⁠‘사업과 직접 관련이 없는 지출에 대한 매입세액’을 규정하고 있다.
 
나.  원심은 그 채택 증거를 종합하여, ① 원고는 재래시장인 서울 동대문구 ⁠(주소 생략) 일대의 동부청과시장 부지에 주상복합건물을 신축·판매하는 내용의 시장정비사업(이하 ⁠‘이 사건 시장정비사업’이라 한다)을 추진하는 계획을 수립한 다음, 이 사건 시장정비사업구역 내 토지면적의 75.6%를 소유하고 있는 동부청과 주식회사(이하 ⁠‘동부청과’라 한다)의 주식인수에 필요한 자문을 제공받기 위하여 2006. 8. 7. 주식회사 씨썬이엔씨(이하 ⁠‘씨썬이엔씨’라 한다)와 이 사건 컨설팅계약을 체결하고, 2007. 1. 5. 그 용역대금으로 25억 원(이하 ⁠‘이 사건 컨설팅대금’이라 한다)을 지급한 사실, ② 이 사건 컨설팅계약에 따른 씨썬이엔씨의 주요 업무는 인수대상 기업의 정보수집·분석·평가 및 선정을 위한 자문, 인수대상 기업 주주와의 교섭 및 투자의향서 작성을 위한 자문, 기타 인수의 성공적 종료를 위하여 필요하다고 인정되는 각종 자문 등인 사실, ③ 동부청과는 약 67명의 주주가 820주 정도를 거의 균등하게 보유하고 있었는데, 2003년경부터 자체적인 시장개발계획을 추진하다가 2005년경 개별 주주의 주식을 매각하는 방식으로 시장개발을 하기로 방침을 정하였고, 이에 따라 2006. 4.경부터 여러 개발사업시행업체가 동부청과에게 주식 등의 매도를 제의한 사실, ④ 원고는 이 사건 컨설팅계약에 의한 자문을 거쳐 동부청과의 주식을 인수한 다음, 2006. 12. 29. 동부청과와 사이에 이 사건 시장정비사업에 관하여 사업승인신청 전의 제반 업무 및 소요자금조달, 사업과 관련된 인허가 업무 등 실질적인 업무 일체를 원고가 수행하되, 사업주체는 동부청과와 공동명의로 하기로 하는 내용의 공동사업약정을 체결한 사실 등을 인정하였다.
원심은 이러한 사실관계에 기초하여, 이 사건 컨설팅대금은 이 사건 시장정비사업 자체의 추진을 위하여 직접 필요한 것이라기보다는 원고가 이 사건 시장정비사업 추진과정에서 지배적 지위를 확보하고 아울러 사업수익의 증대방안을 모색하기 위한 사업기반의 조성을 위하여 투입한 비용에 지나지 아니하여 이 사건 시장정비사업과 직접 관련이 있다고 볼 수 없으므로, 그에 대한 매입세액은 법 제17조 제2항 제2호에서 규정한 불공제대상 매입세액에 해당한다는 취지로 판단하였다.
 
다.  그러나 원심의 판단은 아래와 같은 이유로 수긍하기 어렵다.
 ⁠(1) 현행 부가가치세 과세방법은 원칙적으로 사업자의 자기생산 부가가치에 대해서만 과세가 이루어지도록 하기 위하여 납부세액 산출방식에 있어 자기생산 부가가치와 매입 부가가치를 합한 금액을 공급가액으로 하고, 이에 대하여 징수할 매출세액에서 매입 부가가치에 대하여 지출된 매입세액을 공제하도록 하는 기본적 구조를 채택하고 있다. 이러한 구조 하에서 법 제17조는 매출세액에서 공제하는 매입세액에 관하여 제1항에서 ⁠‘자기의 사업을 위하여 사용되었거나 사용될’ 재화 또는 용역의 공급이나 수입에 대한 세액에 해당하는 이상 그 전부를 공제하도록 규정함으로써 그 기준을 사업 관련성에 두고 있으며, 같은 조 제2항 제2호에서 공제하지 아니하는 매입세액의 하나로 들고 있는 ⁠‘사업과 직접 관련이 없는 지출에 대한 매입세액’은 부가가치세의 원리상 당연히 매출세액에서 공제될 수 없는 경우를 규정하고 있는 것으로 이해된다 ⁠( 대법원 1995. 12. 21. 선고 94누1449 전원합의체 판결 등 참조).
따라서 사업 관련성이 없는 지출에 대한 매입세액은 법 제17조 제1항, 제2항 제2호에 의하여 매출세액에서 공제될 수 없다고 할 것이고, 여기에서 사업 관련성의 유무는 지출의 목적과 경위, 사업의 내용 등에 비추어 그 지출이 사업의 수행에 필요한 것이었는지를 살펴 개별적으로 판단하여야 한다 .
 ⁠(2) 원심판결 이유 및 원심이 적법하게 채택한 증거에 의하면, ① 동부청과는 이 사건 시장정비사업구역 내 토지면적의 약 75%를 소유하고 있어 원고로서는 이 사건 시장정비사업을 시행하기 위해서는 동부청과의 동의가 필수적이었던 사실, ② 그런데 동부청과는 60여 명의 주주들이 거의 균등한 비율로 주식을 보유하는 한편 그 주주들이 동부청과로부터 점포를 임차하여 운영하거나 이를 제3자에게 전대하는 등 이해관계가 복잡하게 얽혀 있었던 사실, ③ 동부청과의 주주들은 2003년경부터 자체적인 시장개발계획을 추진하였으나, 개발비용조달 및 시장 휴장 등의 문제에 관하여 주주들 및 입점 상인들의 의견이 일치하지 아니하여 2005년경 이를 중단하는 대신 주식을 매각하여 새로운 주주들로 하여금 시장개발을 하도록 하는 방침을 세웠고, 이에 따라 시장정비사업을 추진하려는 개발사업시행업체들이 동부청과 주식의 인수를 위한 경쟁을 벌이게 되었던 사실, ④ 이에 원고도 동부청과의 주식을 인수하여 이 사건 시장정비사업을 추진하기로 계획을 세우고 이 사건 컨설팅계약에 의한 자문 등을 거쳐 2006. 12. 28.까지 동부청과의 주주 55명으로부터 주식을 인수하고, 그 다음날인 2006. 12. 29. 동부청과와 이 사건 시장정비사업을 공동으로 시행하는 내용의 공동사업약정을 체결한 사실, ⑤ 그 후에도 원고는 주식인수를 계속하여 동부청과의 주식을 2006. 12. 31. 기준으로 89.55%, 2007. 12. 31. 기준으로 95.52%를 소유하게 되었는데, 동부청과의 주주들로부터 주식을 인수하면서 주주들과 동부청과 사이의 임대차계약에 따른 주주들의 임차인 지위 및 주주들과 입점 상인들 사이의 전대차계약에 따른 주주들의 전대인 지위도 아울러 인수한 사실 등을 알 수 있다.
이러한 사실관계를 앞서 본 법리에 비추어 살펴보면, 원고가 이 사건 시장정비사업을 추진하기 위해서는 이 사건 시장정비사업구역 내 토지면적의 대부분을 소유하고 있던 동부청과의 주식을 인수할 필요가 있었던 것으로 보이므로, 그 주식인수를 위한 이 사건 컨설팅대금의 지출은 이 사건 시장정비사업의 수행에 필요한 것으로서 사업 관련성이 있어 그에 대한 매입세액은 법 제17조 제1항, 제2항 제2호에서 규정한 불공제대상 매입세액에 해당하지 않는다고 봄이 상당하다.
그럼에도 원심은 그 판시와 같은 이유로 이 사건 컨설팅대금이 이 사건 시장정비사업과 직접 관련이 없는 지출에 해당하여 그에 대한 매입세액은 법 제17조 제2항 제2호에서 규정한 불공제대상 매입세액에 해당한다고 판단하였으니, 이러한 원심의 판단에는 법 제17조 제1항, 제2항 제2호에서 규정한 불공제대상 매입세액에 관한 법리를 오해하여 판결에 영향을 미친 위법이 있다. 이 점을 지적하는 원고의 상고이유 주장은 이유 있다.
 
2.  피고의 상고이유에 대하여
법 제17조 제2항 제4호는 매출세액에서 공제하지 아니하는 매입세액의 하나로 ⁠‘부가가치세가 면제되는 재화 또는 용역을 공급하는 사업에 관련된 매입세액(투자에 관련된 매입세액을 포함한다)과 대통령령이 정하는 토지 관련 매입세액’을 들고 있고, 그 위임에 따른 구 부가가치세법 시행령(2010. 2. 18. 대통령령 제22043호로 개정되기 전의 것, 이하 ⁠‘시행령’이라 한다) 제60조 제6항은 ⁠“ 법 제17조 제2항 제4호에서 ⁠‘대통령령이 정하는 토지 관련 매입세액’이라 함은 토지의 조성 등을 위한 자본적 지출에 관련된 매입세액으로서 다음 각 호의 1에 해당하는 매입세액을 말한다.”고 규정하면서, 그 제1호에서 ⁠‘토지의 취득 및 형질변경, 공장 부지 및 택지의 조성 등에 관련된 매입세액’을, 그 제3호에서 ⁠‘토지의 가치를 현실적으로 증가시켜 토지의 취득원가를 구성하는 비용에 관련된 매입세액’을 들고 있다.
원심은 그 판시와 같은 사실을 인정한 다음, 이 사건 각 용역계약의 내용에는 이 사건 시장정비사업구역에 대한 균형발전촉진지구 지정을 위한 내용이 포함되어 있었으나, 이 사건 각 용역계약에 따라 실제로 제공된 용역은 이 사건 시장정비사업 시행을 위한 업무대행용역이었을 뿐 균형발전촉진지구 편입을 위한 용역은 포함되지 않은 점, 이 사건 시장정비사업구역은 용도구역의 변경 없이도 원고가 신축하려 한 주상복합건물의 용적률 및 주상비율을 충족할 수 있었던 점 등을 종합하면, 이 사건 각 용역계약에 따른 매입세액은 법 제17조 제2항 제4호, 시행령 제60조 제6항에서 규정한 토지 관련 매입세액에 해당하지 않는다고 판단하였다.
앞서 본 관련 법령규정과 기록에 비추어 살펴보면, 원심의 위와 같은 판단은 정당한 것으로 수긍이 가고, 거기에 피고가 상고이유에서 주장하는 바와 같은 법 제17조 제2항 제4호, 시행령 제60조 제6항에서 규정한 토지 관련 매입세액에 관한 법리오해 등의 위법이 없다.
 
3.  결론
그러므로 원고의 나머지 상고이유에 대한 판단을 생략한 채 원심판결 중 원고 패소 부분을 파기하고, 이 부분 사건을 다시 심리·판단하게 하기 위하여 원심법원에 환송하기로 하며, 피고의 상고를 기각하기로 하여 관여 대법관의 일치된 의견으로 주문과 같이 판결한다.

대법관 김용덕(재판장) 양창수 이상훈(주심)

출처 : 대법원 2012. 07. 26. 선고 2010두12552 판결 | 사법정보공개포털 판례