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벤처기업과 특수관계자 주식취득 시 과세특례 적용 여부

서면-2021-자본거래-5106[자본거래관리과-459]  ·  2021. 09. 29.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 벤처기업의 발기인이자 최대주주인 특수관계자가 유상증자로 취득한 주식의 양도에 대해 조세특례제한법 제14조 제1항 제4호의 과세특례를 적용받을 수 있습니까?

S요약

벤처기업의 특수관계자유상증자 등 조세특례제한법 제13조 제2항 제2호 방법으로 주식을 취득한 경우, 조세특례제한법 제14조 제1항 제4호의 과세특례는 적용받을 수 없는 것으로 판단됩니다. 따라서 벤처기업의 최대주주, 발기인, 임직원 등 특수관계인은 해당 과세특례 대상에서 제외됩니다.
#벤처기업 #특수관계자 #유상증자 #주식양도 #과세특례 #조세특례제한법
핵심 정리

R회신 내용 서면-2021-자본거래-5106[자본거래관리과-459]  ·  2021. 09. 29.

  • 국세청 서면-2021-자본거래-5106(2021.09.29) 회신에 따르면, 출자받는 벤처기업과 특수관계에 있는 자가 유상증자 등 조특법 제13조 제2항 제2호의 방법으로 주식을 취득한 경우 조특법 제14조 제1항 제4호의 과세특례를 적용받을 수 없다고 답변하였습니다.
  • 특수관계자에는 최대주주, 발기인, 임원, 임직원, 지배주주, 6촌 이내의 혈족, 4촌 이내의 인척 등이 모두 포함됩니다.
  • 과세특례 적용의 배제는 소득세법 시행령 제98조, 법인세법 시행령 제2조 제5항 등에 따른 특수관계인 규정을 근거로 합니다.
  • 관련 예규(사전-2020-법령해석재산-0186 등)에서도 벤처기업 임직원이 벤처기업으로부터 해당 방식으로 주식을 취득한 경우 특례 적용이 불가함을 명시하고 있습니다.
  • 따라서 위 사실관계와 같이 벤처기업의 발기인 및 최대주주가 유상증자를 통해 취득한 주식을 양도하는 경우, 해당 과세특례를 적용받을 수 없다고 판단됩니다.

L관련 법령 해석

  • 조세특례제한법 제14조 제1항 제4호: 벤처기업에 출자해 취득한 대통령령으로 정한 주식의 양도세 비과세 특례 규정
  • 조세특례제한법 제13조 제2항 제2호: 유상증자를 통한 주식 취득 방법 명시(설립 후 7년 이내 증자대금 납입 등)
  • 조세특례제한법 시행령 제13조 제1항 제2호: 소득세법 시행령 제98조 제1항 또는 법인세법 시행령 제2조 제5항(제2호 제외)에 따른 특수관계 없는 경우에만 특례 적용
  • 소득세법 시행령 제98조 및 국세기본법 시행령 제1조의2: 특수관계인 정의(6촌 이내 혈족, 4촌 이내 인척, 임직원, 지배주주 등 포함)
  • 법인세법 시행령 제2조 제5항: 소액주주 등 제외, 임원·경영지배자·30% 이상 출자자를 특수관계인으로 규정
사례 Q&A
1. 벤처기업 최대주주가 유상증자에 참여해 취득한 주식, 양도세 비과세 특례 적용 가능합니까?
답변
벤처기업의 최대주주 등 특수관계인은 조세특례제한법 제14조 제1항 제4호에 따른 양도소득세 비과세 특례를 적용받을 수 없습니다.
근거
국세청은 특수관계자가 벤처기업 유상증자로 취득한 주식에 대해 과세특례가 적용되지 않는다는 유권해석을 내렸습니다.
2. 벤처기업 임원이 조특법 방식으로 취득한 주식, 양도시 과세특례 가능한지?
답변
벤처기업의 임직원경영지배인 역시 특수관계자로 분류되어 과세특례를 받을 수 없습니다.
근거
소득세법 시행령 제98조 등은 임직원, 경영지배인을 특수관계인으로 규정하며, 해당 경우 특례 적용을 배제합니다.
3. 유상증자 참여 특수관계자가 벤처기업 주식 양도시 세금 감면 받을 수 있나?
답변
특수관계자는 조세특례제한법에서 정하는 주식취득 특례의 감면 대상에 해당하지 않습니다.
근거
국세청 회신 및 조세특례제한법 시행령 제13조 제1항 등의 근거로 벤처기업과 특수관계자는 과세특례가 적용되지 않는다고 보았습니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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유권해석 전문

요지

출자받는 벤처기업과「소득세법 시행령」제98조 제1항 또는「법인세법 시행령」제2조 제5항(제2호는 제외한다)에 따른 특수관계가 있는 자가 당해 벤처기업으로부터「조세특례제한법」제13조 제2항 제2호의 방법에 따라 주식을 취득한 경우에는 같은 법 제14조 제1항 제4호에 따른 과세특례를 적용받을 수 없는 것임

회신

귀 질의의 사실관계와 같이,「법인세법 시행령」제2조 제5항 제2호에 해당하는 자인 경우에도 출자받는 벤처기업과「소득세법 시행령」제98조 제1항 또는「법인세법 시행령」제2조 제5항(제2호는 제외한다)에 따른 특수관계가 있는 자가 당해 벤처기업으로부터「조세특례제한법」제13조 제2항 제2호의 방법에 따라 주식을 취득한 경우에는 같은 법 제14조 제1항 제4호에 따른 과세특례를 적용받을 수 없는 것입니다.

【관련 참고자료】

1. 사실관계

 ○㈜○○○(이하 ⁠‘A법인’, 자본금 2억원, 총발행주식수 40천주, 주당액면가액 5천원)는 ’05.3월 설립함

  -신청인은 A법인 설립시 발기인 중 1인이며, 설립시점부터 현재까지 최대주주임(지분율 40%)

 ○A법인 벤처기업 지정 : ’05.12월

 ○A법인 유상증자 : ⁠(1차) ’07.2월, 6억원 / ⁠(2차) ’07.10월, 20.5억원

 ○신청인은 위 유상증자에 참여하여 ’07.2월, 4천주, ’07.10월 126천주를 취득함

 ○A법인 벤처기업 지정 취소 : ’16년도

 ○신청인은 ’21년 하반기에 ⁠‘1차 유상증자’시 취득한 주식 4,000주와 ⁠‘2차 유상증자’시 취득한 주식 중 일부를 양도할 예정임

2. 질의내용

 ○위 사실관계와 같이, A법인의 발기인 중 1인이면서 최대주주인 신청인이 유상증자를 통해 취득한 주식을 양도하는 경우 조특법 §14①4의 규정에 따른 과세특례 대상인지

3. 관련법령

 ○조세특례제한법 제14조【창업자 등에의 출자에 대한 과세특례】

 ① 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 주식 또는 출자지분(제1호ㆍ제2호ㆍ제2호의2ㆍ제2호의3 및 제3호부터 제6호까지의 규정에 따른 주식 또는 출자지분은 제13조제2항 각 호의 어느 하나에 해당하는 방법으로 취득하는 경우만 해당한다)의 양도에 대해서는「소득세법」제94조제1항제3호를 적용하지 아니한다. 다만, 제1호ㆍ제2호ㆍ제2호의2ㆍ제2호의3ㆍ제3호부터 제6호까지 및 제8호의 경우에는 타인 소유의 주식 또는 출자지분을 매입에 의하여 취득하는 경우는 제외한다.

  4. 벤처기업에 출자함으로써 취득(개인투자조합을 통하여 벤처기업에 출자함으로써 취득하는 경우를 포함한다)한 대통령령으로 정하는 주식 또는 출자지분

 ⑧ 제1항제1호는 2009년 12월 31일까지 취득하는 주식 또는 출자지분에 대해서만 적용하고, 제1항제2호ㆍ제2호의2ㆍ제2호의3 및 제3호부터 제8호까지의 규정은 2022년 12월 31일까지 취득하는 주식 또는 출자지분에 대해서만 적용한다.

 ○조세특례제한법 제13조【중소기업창업투자회사 등의 주식양도차익 등에 대한 비과세】

 ② 제1항제1호부터 제4호까지의 규정을 적용할 때 출자는 중소기업창업투자회사, 창업기획자, 벤처기업출자유한회사ㆍ신기술사업금융업자 또는 기금운용법인등이 직접 또는 창투조합등을 통하여 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 방법으로 창업자, 신기술사업자, 벤처기업 또는 신기술창업전문회사의 주식 또는 출자지분을 취득하는 것으로 한다. 다만, 제1호부터 제4호까지의 규정의 경우에는 타인 소유의 주식 또는 출자지분을 매입에 의하여 취득하는 경우는 제외한다.

  1. 해당 기업의 설립 시에 자본금으로 납입하는 방법

  2. 해당 기업이 설립된 후 7년 이내에 유상증자(有償增資)하는 경우로서 증자대금을 납입하는 방법

  3. 해당 기업이 설립된 후 7년 이내에 잉여금을 자본으로 전입(轉入)하는 방법

  4. 해당 기업이 설립된 후 7년 이내에 채무를 자본으로 전환하는 방법

 ○조세특례제한법 시행령 제13조【창업자 등에의 출자에 대한 과세특례】

 ① 법 제14조제1항제4호에서 "대통령령으로 정하는 주식 또는 출자지분"이란 제1호 및 제2호의 규정에 적합한 출자에 의하여 취득한 주식 또는 출자지분으로서 그 출자일부터 3년이 경과된 것을 말한다.

  1. 창업 후 5년 이내인 벤처기업(「벤처기업육성에 관한 특별조치법」제2조제1항에 따른 벤처기업을 말한다. 이하 이 조에서 같다) 또는 벤처기업으로 전환한 지 3년 이내인 벤처기업에 대한 출자일 것. 다만, 창업 후 5년 이내 최초로 출자한 날부터 3년 이내에 추가로 출자하고 최초 출자금액과 추가 출자금액의 합계액이 10억원 이하인 경우에는 창업 후 5년 이내인 벤처기업에 출자한 것으로 본다.

  2. 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 벤처기업에 대한 출자일 것. 다만, 제1호 단서를 적용할 때「법인세법 시행령」제2조 제5항제2호는 적용하지 아니한다.

  가.「소득세법 시행령」제98조제1항 또는「법인세법 시행령」제2조제5항에 따른 특수관계(이하 이 항에서 "특수관계"라 한다)가 없는 벤처기업에 대한 출자

  나.「벤처투자 촉진에 관한 법률」제2조제8호에 따른 개인투자조합이 그 조합원과 특수관계가 없는 벤처기업에 대한 출자

 ○소득세법 시행령 제98조【부당행위계산의 부인】

 ① 법 제41조 및 제101조에서 "특수관계인"이란「국세기본법 시행령」제1조의2제1항, 제2항 및 같은 조 제3항제1호에 따른 특수관계인을 말한다.

 ○국세기본법 시행령 제1조의2 【특수관계인의 범위】

 ① 법 제2조제20호가목에서 "혈족·인척 등 대통령령으로 정하는 친족관계"란 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 관계(이하 "친족관계"라 한다)를 말한다.

  1. 6촌 이내의 혈족

  2. 4촌 이내의 인척

  3. 배우자(사실상의 혼인관계에 있는 자를 포함한다)

  4. 친생자로서 다른 사람에게 친양자 입양된 자 및 그 배우자·직계비속

 ② 법 제2조제20호나목에서 "임원·사용인 등 대통령령으로 정하는 경제적 연관관계"란 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 관계(이하 "경제적 연관관계"라 한다)를 말한다.

  1. 임원과 그 밖의 사용인

  2. 본인의 금전이나 그 밖의 재산으로 생계를 유지하는 자

  3. 제1호 및 제2호의 자와 생계를 함께하는 친족

 ③ 법 제2조제20호다목에서 "주주·출자자 등 대통령령으로 정하는 경영지배관계"란 다음 각 호의 구분에 따른 관계(이하 "경영지배관계"라 한다)를 말한다.

  1. 본인이 개인인 경우

  가. 본인이 직접 또는 그와 친족관계 또는 경제적 연관관계에 있는 자를 통하여 법인의 경영에 대하여 지배적인 영향력을 행사하고 있는 경우 그 법인

  나. 본인이 직접 또는 그와 친족관계, 경제적 연관관계 또는 가목의 관계에 있는 자를 통하여 법인의 경영에 대하여 지배적인 영향력을 행사하고 있는 경우 그 법인

 ○법인세법 시행령 제2조【정의】

 ⑤ 법 제2조제12호에서 "경제적 연관관계 또는 경영지배관계 등 대통령령으로 정하는 관계에 있는 자"란 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 관계에 있는 자를 말한다.

  1. 임원(제40조제1항에 따른 임원을 말한다. 이하 이 항, 제10조, 제19조, 제38조 및 제39조에서 같다)의 임면권의 행사, 사업방침의 결정 등 해당 법인의 경영에 대해 사실상 영향력을 행사하고 있다고 인정되는 자(「상법」제401조의2제1항에 따라 이사로 보는 자를 포함한다)와 그 친족(「국세기본법 시행령」제1조의2제1항에 따른 자를 말한다. 이하 같다)

  2. 제50조제2항에 따른 소액주주등이 아닌 주주 또는 출자자(이하 "비소액주주등"이라 한다)와 그 친족

  3. 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 자 및 이들과 생계를 함께하는 친족

  가. 법인의 임원ㆍ직원 또는 비소액주주등의 직원(비소액주주등이 영리법인인 경우에는 그 임원을, 비영리법인인 경우에는 그 이사 및 설립자를 말한다)

  나. 법인 또는 비소액주주등의 금전이나 그 밖의 자산에 의해 생계를 유지하는 자

  4. 해당 법인이 직접 또는 그와 제1호부터 제3호까지의 관계에 있는 자를 통해 어느 법인의 경영에 대해「국세기본법 시행령」제1조의2제4항에 따른 지배적인 영향력을 행사하고 있는 경우 그 법인

  5. 해당 법인이 직접 또는 그와 제1호부터 제4호까지의 관계에 있는 자를 통해 어느 법인의 경영에 대해「국세기본법 시행령」제1조의2제4항에 따른 지배적인 영향력을 행사하고 있는 경우 그 법인

  6. 해당 법인에 100분의 30 이상을 출자하고 있는 법인에 100분의 30 이상을 출자하고 있는 법인이나 개인

  7. 해당 법인이「독점규제 및 공정거래에 관한 법률」에 따른 기업집단에 속하는 법인인 경우에는 그 기업집단에 소속된 다른 계열회사 및 그 계열회사의 임원

4. 관련예규

 ○사전-2020-법령해석재산-0186, 2020.05.28

   벤처기업의 직원이 벤처기업으로부터「조세특례제한법」제13조 제2항 제2호의 방법에 따라 주식을 취득한 경우에는 같은 법 제14조 제1항 제4호에 따른 과세특례를 적용받을 수 없는 것임

 ○양도, 서면-2019-자본거래-2367, 2020.03.20

  ⁠「조세특례제한법」제14조 제1항 제4호 및 같은 법 시행령 제13조 제1항에 따라 벤처기업에 출자함으로써 취득한 주식 또는 출자지분의 양도와 관련하여,「조세특례제한법 시행령」제13조 제1항 제1호 단서에 따라 창업 후 5년 이내 최초로 출자한 날부터 3년 이내에 추가로 출자하고 최초 출자금액과 추가 출자금액의 합계액이 10억원 이하인 경우에는 창업 후 5년 이내인 벤처기업에 출자한 것으로 보는 것으로, 이 경우에 출자자와 벤처기업이「법인세법 시행령」제2조 제5항 제2호에 따른 특수관계에 있는 경우에는「소득세법」제94조 제1항 제3호를 적용하지 아니하는 것임

 ○양도, 부동산거래관리과-0698,2011.08.09

  「조세특례제한법」제14조【창업자 등에의 출자에 대한 과세특례】제1항 제4호를 적용함에 있어 해당 기업이 설립된 후 7년 이내에 유상증자하는 경우로서 증자대금을 납입하는 방법으로 벤처기업의 주식 또는 출자지분을 취득하는 경우(「상법」에 규정된 주식발행절차에 따라 현물출자를 통하여 벤처기업의 주식 또는 출자지분을 취득하는 경우를 포함함) 당해 과세특례를 적용받을 수 있는 것임

출처 : 국세청 2021. 09. 29. 서면-2021-자본거래-5106[자본거래관리과-459] | 국세법령정보시스템