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위기지역 창업기업 법인세 감면기간, 해제 이후 적용 가능성

서면-2023-법인-1345[법인세과-1011]  ·  2023. 06. 28.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 위기지역 지정기간 중 창업한 기업이 해당 지역 해제 후에도 위기지역 창업기업에 대한 법인세 감면을 잔여 기간 동안 적용받을 수 있나요?

S요약

위기지역에서 지정기간 중에 창업한 내국법인은 위기지역이 해제된 이후에도 감면 잔존기간 동안 법인세 감면을 적용받을 수 있음을 명확히 했습니다. 최초 소득 발생시점부터 정해진 감면기간은 위기지역 해제 여부와 무관하게 유지되며, 관련 조항에 근거해 실무 적용이 가능합니다.
#위기지역 #창업기업 #법인세 감면 #감면기간 #위기지역 해제 #감면적용
핵심 정리

R회신 내용 서면-2023-법인-1345[법인세과-1011]  ·  2023. 06. 28.

  • 국세청 서면-2023-법인-1345[법인세과-1011](2023-06-28) 회신임.
  • 위기지역에서 지정기간 중 감면대상 사업 창업 시, 창업 이후 해당 지역이 위기지역에서 해제되더라도 감면 잔존기간은 보장됨을 명확히 답변하였습니다.
  • 감면적용 기준은 최초 소득발생 과세연도부터 시작하며, 5년간 100%, 추가 2년간 50% 감면을 적용받을 수 있습니다.
  • 위기지역 해제는 이미 감면을 적용받는 기업에 불리하게 작용하지 않으며, 감면기간 내내 요건 충족 시 계속 감면이 적용됨을 안내하고 있습니다.
  • 관련 실무에서 창업일최초 소득 발생일에 따른 감면기간 산정에 유의해야 함을 강조하였습니다.

L관련 법령 해석

  • 조세특례제한법 제99조의9(위기지역 창업기업에 대한 법인세 등의 감면): 위기지역 지정기간 중 창업한 기업에 대해서는 감면 대상기간 동안 법인세 감면 가능
  • 조세특례제한법 제99조의9 제2항: 감면대상사업에서 최초 소득 발생 과세연도 개시일부터 5년(100%) 및 추가 2년(50%) 감면
  • 조세특례제한법 제99조의9 제1항: 위기지역으로 지정 또는 선포된 기간에 창업해야 감면 적용
  • 중소기업창업지원법 시행령 제3조: 법인기업 창업일은 법인설립등기일로 산정
사례 Q&A
1. 위기지역 해제 후에도 창업기업 법인세 감면이 유지되나요?
답변
네, 위기지역 지정기간 중에 창업한 기업은 해당 지역이 해제되어도 감면 잔존기간 동안 법인세 감면을 유지할 수 있습니다.
근거
조세특례제한법 제99조의9와 국세청 유권해석에 근거하여, 감면기간은 창업 및 최초 소득 발생을 기준으로 적용됩니다.
2. 위기지역 창업일 기준이 중요한 이유는 무엇인가요?
답변
창업일이 위기지역 지정기간에 해당되어야만 감면 혜택을 받을 수 있기 때문입니다.
근거
조세특례제한법 제99조의9 제1항은 지정기간 내 창업 기업만을 감면 대상으로 인정합니다.
3. 감면기간 산정 시 최초 소득 발생일이 왜 중요합니까?
답변
최초 소득이 발생한 과세연도부터 감면기간(5+2년)이 기산되기 때문입니다.
근거
조세특례제한법 제99조의9 제2항에 의해 감면 시작점은 최초 소득 발생 연도입니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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유권해석 전문

요지

위기지역에서 위기지역 지정기간 중에 감면대상 사업을 창업한 내국법인은 창업 이후에 해당 지역이 위기지역에서 해제된 경우 감면 잔존기간동안 감면 가능

회신

「조세특례제한법」제99조의9에 의한【위기지역 창업기업에 대한 법인세 등의 감면】을 적용함에 있어서 위기지역에서 위기지역 지정기간 중에 감면대상 사업을 창업한 내국법인은 창업 이후에 해당 지역이 위기지역에서 해제된 경우에도,
감면대상사업에서 최초로 소득이 발생한 과세연도(사업개시일부터 5년이 되는 날이 속하는 과세연도까지 그 사업에서 소득이 발생하지 아니한 경우에는 5년이 되는 날이 속하는 과세연도)의 개시일부터 감면기간 동안 감면을 적용받을 수 있는 것입니다.

1. 사실관계

 ○ 질의법인은 ’21.12.22. 본점 소재지를 전북 군산시로 법인설립등기 함

    * 군산시는 ’18.1.1.-’23.4.4.까지 산업위기대응특별지역, ’18.1.1.-’22.12.31.까지 고용위기지역에 해당

2. 질의내용

 ○ 위기지역 지정기간 중 창업을 하고 위기지역 해제 후 사업이 개시되는 경우, 위기지역 창업기업에 대한 법인세 감면 적용 여부

3. 관련법령

조세특례제한법 제99조의9【위기지역 창업기업에 대한 법인세 등의 감면】

 ① 위기지역에 2023년 12월 31일까지 제6조제3항 각 호에 따른 업종(이하 이 조에서 "감면대상사업"이라 한다)으로 창업하거나 사업장을 신설(기존 사업장을 이전하는 경우는 제외하며, 위기지역으로 지정 또는 선포된 기간에 창업하거나 사업장을 신설하는 경우로 한정한다)하는 기업에 대해서는 제2항부터 제8항까지의 규정에 따라 법인세 또는 소득세를 감면한다.

 ② 제1항에 따른 기업은 감면대상사업에서 발생한 소득에 대하여 감면대상사업에서 최초로 소득이 발생한 과세연도(사업개시일부터 5년이 되는 날이 속하는 과세연도까지 그 사업에서 소득이 발생하지 아니한 경우에는 5년이 되는 날이 속하는 과세연도를 말한다)의 개시일부터 5년 이내에 끝나는 과세연도까지는 소득세 또는 법인세의 100분에 100에 상당하는 세액을 감면하고, 그 다음 2년 이내에 끝나는 과세연도까지는 소득세 또는 법인세의 100분의 50에 상당하는 세액을 감면한다.

 ③ 중소기업 외의 기업이 제2항이 적용되는 감면기간 동안 감면받는 소득세 또는 법인세의 총합계액은 제1호와 제2호의 금액을 합한 금액을 한도(이하 이 조에서 "감면한도"라 한다)로 한다.

  1. 대통령령으로 정하는 투자누계액의 100분의 50

  2. 해당 과세연도에 제1항의 적용대상이 되는 사업장(이하 이 조에서 "감면대상사업장"이라 한다)의 상시근로자 수 × 1천5백만원[청년 상시근로자와 대통령령으로 정하는 서비스업(이하 이 조에서 "서비스업"이라 한다)을 하는 감면대상사업장의 상시근로자의 경우에는 2천만원]

 ④ 제2항에 따라 각 과세연도에 감면받을 소득세 또는 법인세에 대하여 감면한도를 적용할 때에는 제3항제1호의 금액을 먼저 적용한 후 같은 항 제2호의 금액을 적용한다.

 ⑤ 제3항제2호를 적용받아 소득세 또는 법인세를 감면받은 기업이 감면받은 과세연도 종료일부터 2년이 되는 날이 속하는 과세연도 종료일까지의 기간 중 각 과세연도의 감면대상사업장의 상시근로자 수가 감면받은 과세연도의 상시근로자 수보다 감소한 경우에는 대통령령으로 정하는 바에 따라 감면받은 세액에 상당하는 금액을 소득세 또는 법인세로 납부하여야 한다.

 ⑥ 제3항 및 제5항을 적용할 때 상시근로자 및 청년 상시근로자의 범위, 상시근로자의 수의 계산방법, 그 밖에 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

 ⑦ 제1항의 규정을 적용할 때 창업의 범위에 관하여는 제6조제10항을 준용한다.

 ⑧ 제2항에 따라 소득세 또는 법인세를 감면받은 기업이 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 그 사유가 발생한 과세연도의 과세표준신고를 할 때 대통령령으로 정하는 바에 따라 계산한 세액을 소득세 또는 법인세로 납부하여야 한다. 이 경우 제12조의2제8항의 이자상당가산액 등에 관한 규정을 준용한다.

  1. 감면대상사업장의 사업을 폐업하거나 법인이 해산한 경우. 다만, 법인의 합병ㆍ분할 또는 분할합병으로 인한 경우는 제외한다.

  2. 감면대상사업장을 위기지역 외의 지역으로 이전한 경우

 ⑨ 제2항을 적용받으려는 자는 대통령령으로 정하는 바에 따라 감면신청을 하여야 한다.

 ⑩ 제3항제2호에 따라 서비스업에 대한 한도를 적용받는 기업은 제143조를 준용하여 서비스업과 그 밖의 사업을 각각 구분하여 경리하여야 한다.

조세특례제한법 제6조【창업중소기업 등에 대한 세액감면】

 ③ 창업중소기업과 창업벤처중소기업의 범위는 다음 각 호의 업종을 경영하는 중소기업으로 한다.

  2. 제조업(제조업과 유사한 사업으로서 대통령령으로 정하는 사업을 포함한다. 이하 같다)

 ⑩ 제1항부터 제9항까지의 규정을 적용할 때 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우는 창업으로 보지 아니한다.

  1. 합병ㆍ분할ㆍ현물출자 또는 사업의 양수를 통하여 종전의 사업을 승계하거나 종전의 사업에 사용되던 자산을 인수 또는 매입하여 같은 종류의 사업을 하는 경우. 다만, 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 경우는 제외한다.

   가. 종전의 사업에 사용되던 자산을 인수하거나 매입하여 같은 종류의 사업을 하는 경우 그 자산가액의 합계가 사업 개시 당시 토지ㆍ건물 및 기계장치 등 대통령령으로 정하는 사업용자산의 총가액에서 차지하는 비율이 100분의 50 미만으로서 대통령령으로 정하는 비율 이하인 경우

   나. 사업의 일부를 분리하여 해당 기업의 임직원이 사업을 개시하는 경우로서 대통령령으로 정하는 요건에 해당하는 경우

  2. 거주자가 하던 사업을 법인으로 전환하여 새로운 법인을 설립하는 경우

  3. 폐업 후 사업을 다시 개시하여 폐업 전의 사업과 같은 종류의 사업을 하는 경우

  4. 사업을 확장하거나 다른 업종을 추가하는 경우 등 새로운 사업을 최초로 개시하는 것으로 보기 곤란한 경우

조세특례제한법 제30조의3【고용유지중소기업 등에 대한 과세특례】

⑤ 제1항부터 제4항까지의 규정은 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 지역(이하 "위기지역"이라 한다) 내 중견기업의 사업장에 대하여 위기지역으로 지정 또는 선포된 기간이 속하는 과세연도에도 적용한다.

 1. 「고용정책 기본법」 제32조제1항에 따라 지원할 수 있는 지역으로서 대통령령으로 정하는 지역

 2. 「고용정책 기본법」 제32조의2제2항에 따라 선포된 고용재난지역

 3. 「지역 산업위기 대응 및 지역경제 회복을 위한 특별법」 제10조제1항에 따라 지정된 산업위기대응특별지역

중소기업창업지원법 제2조【정의】

 2. "창업"이란 대통령령으로 정하는 바에 따라 중소기업을 새로 설립하는 것을 말한다.

 3. "창업기업"이란 중소기업을 창업하여 사업을 개시한 날부터 7년이 지나지 아니한 기업(법인과 개인사업자를 포함한다)을 말한다. 이 경우 사업 개시에 관한 사항 등 창업기업의 범위에 관한 세부사항은 대통령령으로 정한다.

중소기업창업지원법 시행령 제2조【정의】

 ① ⁠「중소기업창업 지원법」(이하 "법"이라 한다) 제2조제2호의 창업은 중소기업을 새로 설립하여 사업을 개시하는 것으로서 다음 각 호의 어느 하나에 해당하지 않는 것으로 한다.

중소기업창업지원법 시행령 제3조【창업기업의 범위】

 ① 법 제2조제3호, 제6호 및 제10호에 규정된 "사업을 개시한 날"은 다음 각 호의 구분에 따른 날로 한다.

  1. 창업기업 또는 재창업기업이 법인인 경우: 법인설립등기일

  2. 창업기업 또는 재창업기업이 개인인 경우: 「부가가치세법」 제8조제7항에 따른 사업자등록증에 기재된 개업일(법 제45조에 따른 공장 설립계획의 승인을 받아 사업을 개시하는 경우에는 사업자등록증에 기재된 사업자등록일을 말한다)

중소기업기본법 시행령 제2조【정의】

 이 영에서 사용하는 용어의 뜻은 다음과 같다.

 1. "창업일"이란 다음 각 목의 구분에 따른 날을 말한다.

  가. 법인인 기업 : 법인설립등기일

  나.「소득세법」 제168조「부가가치세법」 제8조에 따라 사업자등록을 한 사업자인 기업(법인이 아닌 사업자를 말한다. 이하 이 조에서 같다) : 사업자등록을 한 날

출처 : 국세청 2023. 06. 28. 서면-2023-법인-1345[법인세과-1011] | 국세법령정보시스템