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칼럼 부동산 토지·수용·보상
부동산 · 토지·수용·보상 2026.05.01 조회 638

토지 수용 보상금 받았는데 양도세 비과세 될까? 사례로 알아보기

손수혁 변호사
선우 법률사무소 · 서울특별시 서초구

국가나 지방자치단체의 공익사업으로 내 땅이 수용되면서 보상금을 수령하신 분들이 많으십니다. 그런데 막상 보상금을 받고 나면 양도소득세 문제가 떠오르면서 걱정이 커지시는 경우가 적지 않습니다. "내가 팔고 싶어서 판 것도 아닌데 세금을 내야 하나?"라는 의문을 가지시는 분들이 실무에서 정말 많습니다.

오늘은 토지 수용 보상금과 양도세 비과세 문제를 두 가지 실제와 유사한 사례를 통해 살펴보겠습니다. 같은 수용이라도 요건 충족 여부에 따라 수천만 원의 세금 차이가 생길 수 있으니, 꼼꼼히 확인해 보시기 바랍니다.

사례 A씨 (62세, 경기도 화성시)
A씨는 2003년 아버지로부터 상속받은 화성시 소재 농지 1,200평을 보유하고 있었습니다. 2024년 도로 확장 공익사업으로 해당 토지 전체가 수용 대상이 되었고, 한국토지주택공사(LH)로부터 보상금 4억 8,000만 원을 수령했습니다. A씨는 별도로 주택 1채를 소유하고 있으며, 해당 농지에서 직접 농사를 짓지는 않았습니다.
사례 B씨 (55세, 충남 공주시)
B씨는 2010년에 매입한 공주시 소재 농지 800평에서 15년간 직접 벼농사를 지어왔습니다. 2025년 국도 우회도로 건설을 위해 토지가 수용되면서 보상금 2억 5,000만 원을 받았습니다. B씨는 해당 농지 인근에 거주하며, 다른 부동산은 소유하고 있지 않습니다.

쟁점 1: 공익사업 수용 시 양도세 감면 요건은 무엇인가

많은 분들이 "수용이니까 당연히 비과세 아닌가"라고 생각하시는데, 이 부분에서 오해가 많으십니다. 결론부터 말씀드리면, 공익사업 수용 자체가 양도세 비과세 사유는 아닙니다.

다만, 조세특례제한법 제77조에 따라 공익사업용 토지가 수용될 경우 양도소득세 감면 혜택이 주어질 수 있습니다. 핵심 요건을 정리하면 다음과 같습니다.

공익사업 수용 양도세 감면 핵심 요건
  • 사업인정고시일(해당 사업이 공익사업으로 인정된 날)로부터 소급하여 2년 이전에 취득한 토지일 것
  • 토지소유자가 토지보상법에 따른 협의 매수 또는 수용 재결에 의해 양도할 것
  • 보상금을 현금이 아닌 채권으로 수령하면 추가 감면율 적용 (3년 만기 채권 수령 시 양도세 15% 감면, 5년 만기 시 40% 감면)

A씨의 경우 2003년에 상속받은 토지이므로 사업인정고시일 2년 이전 취득 요건은 충족합니다. 그러나 A씨가 현금으로 보상금을 수령했다면 감면율은 10%에 그치게 됩니다. 만약 3년 만기 채권으로 수령했다면 15%, 5년 만기 채권이라면 40%까지 감면받을 수 있었습니다.

이처럼 보상금 수령 방식에 따라 세금이 크게 달라지므로, 수용 통보를 받으신 시점에서 미리 세금 시뮬레이션을 해보시는 것이 매우 중요합니다.

쟁점 2: 8년 자경농지 양도세 감면 특례 적용 여부

B씨의 상황은 A씨와 상당히 다릅니다. B씨에게 주목해야 할 것은 조세특례제한법 제69조의 8년 자경농지 양도소득세 감면 특례입니다.

8년 자경농지 감면 요건
  • 농지 소재지 또는 연접 시군구에 거주하면서
  • 통산 8년 이상 직접 경작(자경)한 사실이 있을 것
  • 양도일 현재 해당 농지가 농지로서의 요건을 유지하고 있을 것
  • 감면 한도: 해당 과세기간 1억 원, 5년간 합산 2억 원

B씨는 2010년 취득 후 15년간 공주시에 거주하며 직접 벼농사를 지어왔으므로 8년 자경 요건을 충족합니다. 보상금 2억 5,000만 원에서 취득가액과 필요경비를 차감한 양도차익이 약 1억 8,000만 원이라 가정하면, 1억 원까지는 자경농지 감면으로 세금을 면제받을 수 있습니다.

여기에 앞서 설명한 공익사업 수용 감면(조특법 제77조)을 중복 적용받을 수도 있는데, 이 경우 감면 순서와 한도 계산이 복잡해지므로 반드시 세무 전문가의 검토를 받으시길 권합니다.

B씨 - 감면 가능

15년 자경, 농지 소재지 거주

8년 자경농지 감면 적용

공익사업 감면 중복 적용 가능

A씨 - 자경 감면 불가

직접 경작 사실 없음

자경농지 감면 적용 불가

공익사업 감면만 적용 가능

A씨처럼 상속받은 농지를 직접 경작하지 않고 보유만 한 경우, 자경농지 감면은 적용되지 않습니다. 다만 피상속인(돌아가신 아버지)의 자경 기간을 승계받을 수 있는 예외 규정도 있으므로, 상속농지라면 이 부분도 꼭 확인해 보셔야 합니다.

쟁점 3: 대토보상을 선택하면 과세이연이 가능한가

수용 보상금을 받는 방법에는 현금, 채권 외에도 대토보상(다른 토지로 보상받는 것)이 있습니다. 이 방식을 활용하면 양도세를 당장 내지 않고 뒤로 미룰 수 있는 과세이연(과세 시점을 나중으로 연기) 효과를 얻을 수 있습니다.

대토보상 과세이연 핵심 사항
  • 공익사업시행자로부터 해당 사업지구 내 조성 토지로 보상받을 것
  • 보상받은 토지를 향후 양도할 때까지 양도세 납부를 이연
  • 대토보상 신청 기한: 보상 협의 시 또는 수용 재결 전까지
  • 나중에 대토를 양도할 때 최초 수용 시의 양도차익까지 합산 과세

만약 A씨가 화성시 개발 사업지구 내 조성 토지를 대토보상으로 받았다면, 수용 시점의 양도소득세 약 5,000만 원 이상을 당장 납부하지 않아도 됩니다. 물론 해당 토지를 나중에 처분할 때 합산 과세되므로 세금이 사라지는 것은 아니지만, 당장의 자금 부담을 줄이는 데 큰 도움이 됩니다.

다만 대토보상은 모든 수용 사업에서 가능한 것은 아니고, 사업시행자가 대토보상을 시행하는 경우에만 신청할 수 있습니다. 또한 보상받은 토지의 가치 변동 리스크도 고려하셔야 합니다.

실무적으로 꼭 기억하셔야 할 점

첫째, 수용 보상금을 받기 전에 현금/채권/대토 중 어떤 방식이 유리한지 반드시 세금 시뮬레이션을 해보셔야 합니다. 보상 협의가 완료된 후에는 수령 방식을 변경하기 어렵습니다.

둘째, 자경농지 감면은 자경 기간을 입증할 수 있는 자료(농협 출하 내역, 농자재 구매 영수증, 농지원부 등)가 핵심입니다. 평소에 자경 증빙을 꾸준히 모아두시는 것이 좋습니다.

셋째, 수용 후 양도세 신고 기한은 보상금 수령일이 속하는 달의 말일부터 2개월 이내입니다. 기한을 넘기면 가산세가 부과되므로, 보상금을 수령하셨다면 빠르게 세무 상담을 진행하시는 것이 바람직합니다.
손수혁
손수혁 변호사의 코멘트
선우 법률사무소 · 서울특별시 서초구
수용 보상 사건을 다루면서 느끼는 점은, 보상금 수령 방식 하나로 세금이 수천만 원 달라질 수 있다는 사실을 뒤늦게 아시는 분들이 많다는 것입니다. 사업인정고시 단계에서 미리 전문가 상담을 받으시면 감면 특례를 최대한 활용할 수 있습니다.
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