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비영리법인 공통 고정자산 처분 양도차익 안분계산

서면-2018-법인-1532[법인세과-1526]  ·  2018. 06. 21.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통 사용한 고정자산을 처분할 때 발생하는 양도차익은 어떻게 세무처리해야 하나요?

S요약

비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 모두 사용한 고정자산을 처분할 때 발생한 양도차익은 수익사업과 고유목적사업의 수입금액 또는 매출액에 비례하여 안분계산해야 하며, 예외적으로 적용이 곤란한 경우에는 사용면적 등 별도 기준에 따를 수 있습니다.
#비영리법인 #고정자산 처분 #양도차익 #수익사업 #고유목적사업 #세무처리
핵심 정리

R회신 내용 서면-2018-법인-1532[법인세과-1526]  ·  2018. 06. 21.

  • 국세청 서면-2018-법인-1532[법인세과-1526] 회신에 따름.
  • 비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통으로 사용한 고정자산을 처분하면, 법인세법 시행규칙 제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업의 수입금액 또는 매출액 비율로 안분하여 양도차익을 계산해야 함을 안내하였습니다.
  • 적용이 불가능하거나 불합리할 때에는 사용면적, 작업시간, 사용시간 등 국세청장이 정하는 기준에 따라 안분계산하도록 인정하였습니다.
  • 익금에 산입되는 금액은 수익사업 비율에 해당하는 부분에 한정됨을 명확히 하였습니다.
  • 3년 이상 고유목적사업에 직접 사용한 고정자산이 아닌 경우, 해당 처분이 수익사업 소득에 모두 포함될 수 있으니 주의가 필요하다는 점을 언급하였습니다.

L관련 법령 해석

  • 법인세법 제3조(과세소득의 범위): 비영리내국법인의 각 사업연도 소득에 수익사업에서 생기는 소득, 고정자산 처분 소득 등이 포함됨.
  • 법인세법 시행령 제2조: 3년 이상 고유목적사업에 직접 사용한 고정자산 처분분은 법인세 과세 제외.
  • 법인세법 제113조(구분경리): 비영리법인이 수익사업을 할 경우 자산·부채 및 손익을 구분하여 기록해야 함.
  • 법인세법 시행규칙 제76조 제6항: 공통 익금은 수익사업과 기타 사업의 수입금액 또는 매출액에 비례해 안분계산, 예외적 상황 시 사용면적 등 기준에 따름.
사례 Q&A
1. 비영리법인 고정자산을 공동 사용하는 경우 처분 시 양도차익 안분 방법은?
답변
공동 사용 고정자산 처분 양도차익은 수익사업과 고유목적사업의 수입금액 또는 매출액 비율로 안분해 산출하는 것이 원칙입니다.
근거
국세청 해석과 법인세법 시행규칙 제76조 제6항에서 이 원칙을 확립하고 있습니다.
2. 수익사업과 고유목적사업에 모두 사용된 자산 처분시 적용 예외 기준은?
답변
원칙적 안분이 불가하거나 불합리할 경우 사용면적, 시간 등 실질 기준으로 안분할 수 있습니다.
근거
법인세법 시행규칙 제76조 제6항 단서와 국세청 회신에서 예외 인정이 명시되었습니다.
3. 비영리법인 고유목적사업에만 3년 이상 사용한 자산은 처분 시 법인세 과세 여부는?
답변
고유목적사업에 3년 이상 직접 사용한 고정자산 처분분은 법인세가 과세되지 않을 수 있음을 안내하였습니다.
근거
법인세법 시행령 제2조 제2항 및 관련 국세청 해석에서 해당 기준을 확인할 수 있습니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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요지

비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통으로 사용하던 고정자산을 처분하여 발생하는 양도차익은「법인세법 시행규칙」제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업의 수입금액 또는 매출액에 비례하여 안분계산하는 것임

회신

비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통으로 사용하던 고정자산을 처분하여 발생하는 양도차익은「법인세법 시행규칙」제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업의 수입금액 또는 매출액에 비례하여 안분계산하는 것이며
다만, 이를 적용할 수 없거나 적용하는 것이 불합리한 경우에는 공통익금의 수입항목에 따라 국세청장이 정하는 작업시간·사용시간·사용면적등의 기준에 따라 안분계산하여 수익사업 부문에 해당하는 금액을 익금에 산입하는 것입니다.

1. 사실관계

○ 질의법인은 00시에 소재하는 종합주류도매업을 경영하는 법인을 회원으로 하고 목적사업(건전한 주류유통질서 확립, 회원 간 복리증진 등)을 수행하는 비영리법인으로

- 00시 00구 00동 00번지 토지(1,043㎡)와 건물 1층(부동산임대, 193.72㎡), 2층(질의법인 사용, 193.72㎡)을 소유(2002.3.26. 취득)하고 있으며 토지는 질의법인과 임차인이 주차장으로 공동 사용하고 있음

○ 한편, 질의법인은 2018년에 토지 중 123㎡와 도로에 편입된 수목, 돌 등이 대구시가 시행하는 도로확장 사업에 편입되어 양도되는 경우

- 고유목적 사업에 사용하는 고정자산의 세무처리 방법을 질의함

  

2. 질의내용

○ 비영리내국법인이 수익사업과 고유목적사업에 공통으로 사용하던 고정자산의 처분 시 세무처리

3. 관련법령

법인세법 제3조【과세소득의 범위】

① 법인세는 다음 각 호의 소득에 대하여 부과한다. 다만, 비영리내국법인과 외국법인에 대하여는 제1호 및 제3호의 소득에 대하여만 법인세를 부과한다.

1. 각 사업연도의 소득

2. 청산소득(淸算所得)

3. 제55조의2 및 제95조의2에 따른 토지등 양도소득

4. 제56조에 따른 미환류소득

② ⁠(생략)

③ 비영리내국법인의 각 사업연도의 소득은 다음 각 호의 사업 또는 수입(이하 수익사업 이라 한다)에서 생기는 소득으로 한다.

1. 제조업, 건설업, 도매업ㆍ소매업, 소비자용품수리업, 부동산ㆍ임대 및 사업서비스업 등의 사업으로서 대통령령으로 정하는 것

2.「소득세법」제16조 제1항에 따른 이자소득

3.「소득세법」제17조 제1항에 따른 배당소득

4. 주식ㆍ신주인수권(新株引受權) 또는 출자지분(出資持分)의 양도로 인하여 생기는 수입

5. 고정자산(고유목적사업에 직접 사용하는 고정자산으로서 대통령령으로 정하는 것은 제외한다)의 처분으로 인하여 생기는 수입

6.「소득세법」제94조 제1항 제2호 및 제4호에 따른 자산의 양도로 인하여 생기는 수입

7. 제1호부터 제6호까지의 규정 외에 대가(對價)를 얻는 계속적 행위로 인하여 생기는 수입으로서 대통령령으로 정하는 것

법인세법 시행령 제2조【수익사업의 범위】

① ⁠(생략)

② 법 제3조 제3항 제5호에서 대통령령으로 정하는 것이란 해당 고정자산의 처분일 현재 3년 이상 계속하여 법령 또는 정관에 규정된 고유목적사업(제1항에 따른 수익사업은 제외한다)에 직접 사용한 것을 말한다. 이 경우 해당 고정자산의 유지ㆍ관리 등을 위한 관람료ㆍ입장료수입 등 부수수익이 있는 경우에도 이를 고유목적사업에 직접 사용한 고정자산으로 본다.

법인세법 제113조【구분경리】

① 비영리법인이 수익사업을 하는 경우에는 자산ㆍ부채 및 손익을 그 수익사업에 속하는 것과 수익사업이 아닌 그 밖의 사업에 속하는 것을 각각 다른 회계로 구분하여 기록하여야 한다.

②∼⑤ ⁠(생략)

⑥ 제1항부터 제5항까지의 규정에 따른 구분경리의 방법, 동일사업을 하는 법인의 판정, 그 밖에 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

법인세법 시행령 제156조【구분경리】

① 법 제113조 제1항부터 제5항까지의 규정에 해당하는 법인은 구분하여야 할 사업 또는 재산별로 자산·부채 및 손익을 법인의 장부상 각각 독립된 계정과목에 의하여 기획재정부령으로 정하는 바에 따라 구분경리하여야 한다.

(이하생략)

법인세법 시행규칙 제75조【구분경리의 범위】

①영 제156조의 규정에 의한 구분경리를 할 때에는 구분하여야 할 사업 또는 재산별로 자산·부채 및 손익을 각각 독립된 계정과목에 의하여 구분기장하여야 한다. 다만, 각 사업 또는 재산별로 구분할 수 없는 공통되는 익금과 손금은 그러하지 아니하다.

(이하생략)

법인세법 시행규칙 제76조 【비영리법인의 구분경리】

① 비영리법인이 법 제113조 제1항의 규정에 의하여 구분경리하는 경우 수익사업과 기타의 사업에 공통되는 자산과 부채는 이를 수익사업에 속하는 것으로 한다.

②∼⑤ ⁠(생략)

⑥ 비영리법인이 법 제113조 제1항의 규정에 의하여 수익사업과 기타의 사업의 손익을 구분경리하는 경우 공통되는 익금과 손금은 다음 각호의 규정에 의하여 구분계산하여야 한다. 다만, 공통익금 또는 손금의 구분계산에 있어서 개별손금(공통손금외의 손금의 합계액을 말한다. 이하 이 조에서 같다)이 없는 경우나 기타의 사유로 다음 각호의 규정을 적용할 수 없거나 적용하는 것이 불합리한 경우에는 공통익금의 수입항목 또는 공통손금의 비용항목에 따라 국세청장이 정하는 작업시간·사용시간·사용면적등의 기준에 의하여 안분계산한다.

1. 수익사업과 기타의 사업의 공통익금은 수익사업과 기타의 사업의 수입금액 또는 매출액에 비례하여 안분계산

2. 수익사업과 기타의 사업의 업종이 동일한 경우의 공통손금은 수익사업과 기타의 사업의 수입금액 또는 매출액에 비례하여 안분계산

3.수익사업과 기타의 사업의 업종이 다른 경우의 공통손금은 수익사업과 기타의 사업의 개별 손금액에 비례하여 안분계산

4. 관련사례

○ 사전-2016-법령해석법인-0194, 2016.12.22.

위 세법해석 사전답변 신청의 사실관계와 같이 비영리내국법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통으로 사용하던 고정자산을 처분하여 발생하는 양도차익은「법인세법 시행규칙」제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업에 해당하는 양도차익을 안분하여 수익사업 부문에 해당하는 금액을 익금에 산입하는 것임

○ 사전-2015-법령해석법인-0389, 2016.3.15.

수익사업(주차장사업)을 영위하는 비영리법인은 손익을 수익사업에 속하는 것과 기타의 사업(단지관리사업)에 속하는 것을 각각 다른 회계로 구분하여 경리하여야 하고, 수익사업과 기타의 사업에 공통되는 익금과 손금은「법인세법 시행규칙」제76조 제6항 각 호에 따라 구분계산하여야 하는 것임

다만, 개별손금이 없는 경우나 기타의 사유로 각 호의 규정을 적용할 수 없거나 적용하는 것이 불합리한 경우에는 공통익금의 수입항목 또는 공통손금의 비용항목에 따라 국세청장이 정하는 작업시간・사용시간・사용면적 등의 기준에 의하여 안분계산하는 것임

귀 사전답변 신청의 주차요금 유료차량과 무료차량의 주차장 사용시간에 따라 공통손금을 안분계산 하는 것이 같은 법 시행규칙 제76조 제6항 본문 단서에 따른 안분계산에 해당하는지 여부는 공통손금의 비용항목, 주차장 사용현황, 안분기준의 합리성 등을 종합적으로 고려하여 사실판단할 사항임

○ 법인, 법규법인2014-103, 2014.4.22.

비영리법인이 수익사업과 3년 이상 고유목적사업에 공통으로 사용하던 고정자산을 처분하는 경우 양도차익은 양도가액에서 세무상 장부가액을 차감하여 산정하는 것이며, 이때「법인세법 시행규칙」제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업에 해당하는 양도차익을 안분하여 수익사업 부문에 해당하는 금액을 익금에 산입하는 것임

비영리법인이 수익사업과 고유목적에 공통으로 사용하는 자산에 대해 국고보조금을 수령한 경우에는「법인세법 시행규칙」제76조 제6항에 따라 수익사업과 고유목적사업에 해당하는 국고보조금을 안분하여 수익사업 부문에 해당하는 금액을 익금에 산입하는 것임

○ 법인세과-313, 2012.5.22. ⁠(←법규과-341, 2012.4.6.)

비영리내국법인이 수익사업과 고유목적 사업에 공통으로 사용하던 부동산(청사, 사택)을 양도하는 경우 양도일 현재 고유목적사업에 3년 이상 계속하여 사용하던 부분에 대하여는 「법인세법」 제3조제3항제5호 및 같은 법 시행령 제2조제2항의 규정에 의하여 각 사업연도소득에 대한 법인세가 과세되지 아니함

○ 법인-598, 2009.5.21.(주차장 일부 토지를 임대업에 사용)

비영리내국법인이 고정자산 처분일 현재 3년 이상 계속하여 법령 또는 정관에 규정된 고유목적사업(수익사업 제외)에 직접 사용한 경우에는 당해 고정자산의 처분으로 인하여 생기는 수입은「법인세법 시행령」제2조 제2항의 규정에 따라 법인세가 과세되지 않는 것임

출처 : 국세청 2018. 06. 21. 서면-2018-법인-1532[법인세과-1526] | 국세법령정보시스템