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조세특례 주택 양도세 감면 시 농어촌특별세 납부여부

서면-2016-부동산-4722[부동산납세과-1290]  ·  2016. 08. 23.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 조세특례제한법 제99조의2 제1항에 따라 신축주택 등 양도소득세가 감면된 경우 농어촌특별세를 별도로 납부해야 하는지?

S요약

조세특례제한법 제99조의2에 따라 신축주택 등 취득 후 5년 이내 양도 시 양도소득세 감면을 적용받았다면, 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 납부해야 한다는 점이 명확히 안내되었습니다.
#조세특례제한법 #신축주택 #양도소득세 #감면세액 #농어촌특별세 #세율
핵심 정리

R회신 내용 서면-2016-부동산-4722[부동산납세과-1290]  ·  2016. 08. 23.

  • 국세청 서면-2016-부동산-4722[부동산납세과-1290](2016.08.23) 유권해석입니다.
  • 조세특례제한법 제99조의2 제1항에 따라 양도소득세 감면을 받은 경우에는 농어촌특별세법 제3조 및 제5조에 따라 해당 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 납부해야 한다고 명시하였습니다.
  • 상기 유권해석은 2013년 4월 1일부터 2013년 12월 31일까지 신규 주택 취득 및 관련 양도 사례에 적용됩니다.
  • 동일한 취지로 서면-2015-부동산-2422(2016.03.25), 서면-2015-법령해석재산-2017(2015.12.07)에서도 조세특례에 의한 양도소득세 감면 시 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 납부해야 한다고 회신하였습니다.
  • 따라서 신축주택 등 양도에 대해 양도소득세 감면을 받은 경우에는 반드시 그 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 산정하여 신고·납부하셔야 함을 안내합니다.

L관련 법령 해석

  • 조세특례제한법 제99조의2(신축주택 등 취득자에 대한 양도소득세 과세특례): 일정 요건 충족 시 양도소득세의 100% 감면 또는 5년간 발생 소득만 공제
  • 조세특례제한법 제99조의2 제4항: 감면 적용을 위해서는 감면 대상임을 확인받아 제출해야 함
  • 농어촌특별세법 제2조(정의): 조특법에 따른 세액감면은 농어촌특별세 부과 대상임을 명시
  • 농어촌특별세법 제3조(납세의무자): 조특법 등에서 감면을 받는 자는 농어촌특별세 납세의무자
  • 농어촌특별세법 제5조(과세표준과 세율): 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 납부함
사례 Q&A
1. 신축주택 양도 시 양도소득세 감면받았을 때 농어촌특별세도 내야 하나요?
답변
네, 감면받은 양도소득세의 20%는 농어촌특별세로 별도 납부 대상입니다.
근거
조세특례제한법 제99조의2 및 농어촌특별세법 제3조, 제5조에 따라 감면세액의 20% 농특세 납부 규정이 적용됩니다.
2. 신축주택 5년 이내 양도 시 양도세 전액 감면받으면 세금 신고는 어떻게 하나요?
답변
양도소득세는 감면되지만 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 신고·납부해야 합니다.
근거
해당 감면세액이 기준이고, 농특세를 반드시 신고·납부해야 함이 국세청 회신으로 확인되었습니다.
3. 조세특례제한법 감면 주택과 농어촌특별세 납부 대상이 궁금합니다.
답변
주택 감면세액이 발생하면 감면세액의 20%가 농어촌특별세 납부 대상임을 참고하셔야 합니다.
근거
조세특례제한법 감면세액 기준으로 농촌특별세법상 별도 세액 산정 의무가 적용됨을 유권해석에서 명확히 밝혔습니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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유권해석 전문

요지

「조세특례제한법」제99조의 2제1항에 따라 양도소득세의 감면을 받는 경우 감면세액에 100분의 20을 곱하여 계산한 금액을 농어촌특별세로 납부하는 것임

회신

「조세특례제한법」제99조의 2제1항에 따라 양도소득세의 감면을 받는 경우 ⁠「농어촌특별세법」제3조 및 제5조에 따라 해당 감면세액에 100분의 20을 곱하여 계산한 금액을 농어촌특별세로 납부하는 것입니다.

※ 관련참고자료

1. 질의내용 요약

 ○ 사실관계

  - 2013.05.14. 주택 분양권계약 체결

  - 2014.01.16. 신축주택등 또는 감면대상기존주택임을 확인하는 날인을 받음

  - 2016.07.00. 완공된 신축주택 양도

 ○ 질의내용

  ⁠「조세특례제한법」제99조의 2제1항에 따라 양도소득세를 감면받는 경우, 농어촌특별세를 납부하는 것인지

2. 질의내용에 대한 자료

가. 관련 법령 ⁠(법률, 시행령, 시행규칙, 기본통칙)

조세특례제한법 제99조의2 【신축주택 등 취득자에 대한 양도소득세의 과세특례】

① 거주자 또는 비거주자가 대통령령으로 정하는 신축주택, 미분양주택 또는 1세대 1주택자의 주택으로서 취득가액이 6억원 이하이거나 주택의 연면적(공동주택의 경우에는 전용면적)이 85제곱미터 이하인 주택을 2013년 4월 1일부터 2013년 12월 31일까지 「주택법」 제38조에 따라 주택을 공급하는 사업주체 등 대통령령으로 정하는 자와 최초로 매매계약을 체결하여 그 계약에 따라 취득(2013년 12월 31일까지 매매계약을 체결하고 계약금을 지급한 경우를 포함한다)한 경우에 해당 주택을 취득일부터 5년 이내에 양도함으로써 발생하는 양도소득에 대하여는 양도소득세의 100분의 100에 상당하는 세액을 감면하고, 취득일부터 5년이 지난 후에 양도하는 경우에는 해당 주택의 취득일부터 5년간 발생한 양도소득금액을 해당 주택의 양도소득세 과세대상소득금액에서 공제한다. 이 경우 공제하는 금액이 과세대상소득금액을 초과하는 경우 그 초과금액은 없는 것으로 한다.

② ~ ③ 생략

④ 제1항에 따른 양도소득세의 감면은 대통령령으로 정하는 방법에 따라 제1항에 따른 감면 대상 주택임을 확인받아 납세지 관할 세무서장에게 제출한 경우에만 적용한다.

⑤ 생략

농어촌특별세법 제2조 【정의】

① 이 법에서 "감면"이란 ⁠「조세특례제한법」ㆍ「관세법」ㆍ「지방세법」 또는 ⁠「지방세특례제한법」에 따라 소득세ㆍ법인세ㆍ관세ㆍ취득세 또는 등록에 대한 등록면허세가 부과되지 아니하거나 경감되는 경우로서 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 것을 말한다.

1. 비과세ㆍ세액면제ㆍ세액감면ㆍ세액공제 또는 소득공제

2. 「조세특례제한법」 제72조제1항에 따른 조합법인 등에 대한 법인세 특례세율의 적용 또는 같은 법 제89조제1항 및 제89조의3에 따른 이자소득ㆍ배당소득에 대한 소득세 특례세율의 적용

3. 「지방세법」 제15조제1항에 따른 취득세 특례세율의 적용

(이하 이 조 생략)

농어촌특별세법 제3조 【납세의무자】

다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 자는 이 법에 따라 농어촌특별세를 납부할 의무를 진다.

1. 제2조제1항 각 호 외의 부분에 규정된 법률에 따라 소득세ㆍ법인세ㆍ관세ㆍ취득세 또는 등록에 대한 등록면허세의 감면을 받는 자

2. 삭제

3. 「개별소비세법」 제1조제2항의 물품 중 같은 항 제1호가목1)ㆍ2), 같은 호 다목, 같은 항 제2호나목1)ㆍ2)의 물품 또는 같은 조 제3항제4호의 입장행위에 대한 개별소비세 납세의무자

4. 「증권거래세법」 제3조제1호에 규정된 증권거래세 납세의무자

5. ⁠「지방세법」에 따른 취득세 또는 레저세의 납세의무자

6. ⁠「종합부동산세법」에 따른 종합부동산세의 납세의무자

농어촌특별세법 제5조(과세표준과 세율)

① 농어촌특별세는 다음 각 호의 과세표준에 대한 세율을 곱하여 계산한 금액을 그 세액으로 한다.

나. 유사사례 ⁠(판례, 심판례, 심사례, 예규)

○ 서면-2015-부동산-2422(2016.03.25)

1. 생략

2. 귀 질의 2의 경우, ⁠「조세특례제한법」제99조의2제1항에 해당하는 감면대상 주택을 취득하고 그 취득일부터 5년 이내에 양도함으로써 발생하는 양도소득에 대하여는 양도소득세의 100%를 감면하고, 취득일부터 5년이 지난 후에 양도하는 경우에는 해당 주택의 취득일부터 5년간 발생한 양도소득금액을 해당주택의 양도소득세 과세대상소득금액에서 공제하는 것입니다. 이 경우, 감면세액의 20%를 농어촌특별세로 납부하는 것입니다.

3. ~ 4. 생략

○ 서면-2015-법령해석재산-2017(2015.12.07)

「조세특례제한법」제99조의2 제1항에 따른 1세대1주택자의 주택을 양도하는 경우로서 해당 주택이 ⁠「소득세법」제89조 제1항 제3호 및 같은 법 시행령 제156조에 따른 1세대1주택이면서 고가주택에 해당하는 경우에는 같은 법 제95조 제3항 및 같은 법 시행령 제160조를 적용한 후 ⁠「조세특례제한법」제99조의2 규정을 적용하는 것입니다.

이 경우 ⁠「농어촌특별세법」제3조 및 제5조에 따라 해당 감면세액에 100분의20을 곱하여 계산한 금액을 농어촌특별세로 납부하는 것입니다.

출처 : 국세청 2016. 08. 23. 서면-2016-부동산-4722[부동산납세과-1290] | 국세법령정보시스템