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산학협력단의 기술지주회사 물적분할, 부가세 사업양도 해당 판단

서면-2014-법령해석부가-22066  ·  2015. 06. 10.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 산학협력단이 법인세법 요건을 갖춘 물적분할로 기술지주회사를 설립하며 특허 등 재화와 인력을 이전하는 경우, 이 절차가 부가가치세법상 사업양도에 해당하는지 궁금합니다.

S요약

국세청은 산학협력단이 법인세법 요건을 갖춘 물적분할을 통해 기술지주회사를 설립하면서 기술, 특허, 자산, 부채 및 연구인력 등을 포괄적으로 승계시킬 경우 부가가치세법상 사업양도에 해당한다고 해석하였습니다. 다만, 분할 대상 사업이 독립된 사업부문인지, 법인세법상 물적분할 요건을 충족하는지는 개별 사실판단이 필요합니다.
#산학협력단 #기술지주회사 #물적분할 #사업양도 #부가가치세 #포괄승계
핵심 정리

R회신 내용 서면-2014-법령해석부가-22066  ·  2015. 06. 10.

  • 국세청 서면-2014-법령해석부가-22066(2015.06.10) 회신에 따르면 본 질의사항은 다음과 같습니다.
  • 산학협력단이 법인세법 제47조 제1항의 요건에 따라 물적분할(현물출자 방식 포함)로 분할신설법인(기술지주회사)을 설립하면서 부가가치세 과세사업 부문 자산, 부채, 인력 등을 포괄적으로 승계시킨 경우 ‘사업양도’에 해당된다고 국세청은 판단하였습니다.
  • 해당 사업이 독립하여 분리 가능한 사업부문에 해당하고, 자산 및 부채 포괄 승계 등 법인세법상 물적분할 요건을 실제로 충족하는지 여부는 관련 사실을 종합적으로 검토하여 판단해야 함을 명시하였습니다.
  • 따라서 산학협력단이 사업양도 요건을 모두 충족한다면 분할 과정에서 부가가치세법상 재화의 공급으로 보지 아니하는 사업양도로 처리할 수 있습니다.
  • 다만, 모든 분할이 곧장 사업양도에 해당하지 않으므로, 실제 분할방식·승계범위·사업부문 독립성을 입증할 객관적 자료 및 요건 충족 여부를 추가로 검토해야 합니다.

L관련 법령 해석

  • 부가가치세법 제10조 제8항: 사업을 양도하는 경우에 해당하는 거래는 재화의 공급으로 보지 않음
  • 부가가치세법 시행령 제23조: 사업장별로 해당 사업에 관한 모든 권리와 의무를 포괄적으로 승계하는 사업양도만 인정
  • 법인세법 제46조·제47조: 물적분할의 경우 분할 대상 사업이 독립된 사업부문이고, 자산 및 부채가 포괄적으로 승계되어야 하며, 일정 요건들이 충족되어야 함
  • 산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률 제36조의2~제36조의4: 산학협력단의 기술지주회사 설립 및 자회사 현물출자 방식, 관련 요건 규정
사례 Q&A
1. 산학협력단이 기술지주회사로 자산과 특허를 분할하면 부가가치세가 면제되나요?
답변
관련 요건을 충족할 경우, 부가가치세법상 사업양도에 해당하므로 부가세 과세대상에서 제외될 수 있습니다.
근거
부가가치세법 제10조 제8항 및 시행령 제23조에서 사업양도는 재화의 공급이 아니라고 규정합니다.
2. 기술지주회사 설립 시 어떤 분할요건을 충족해야 사업양도로 인정받을 수 있나요?
답변
사업부문이 독립적으로 분리 가능하고, 자산·부채가 포괄적으로 승계되며, 법인세법상 물적분할 요건이 충족되어야 합니다.
근거
법인세법 제46조·제47조 및 부가가치세법 시행령 제23조가 요구하는 분할 조건과 포괄승계 기준이 명확히 규정되어 있습니다.
3. 모든 산학협력단의 물적분할이 부가가치세 사업양도에 무조건 해당하나요?
답변
아닙니다. 사업부문 독립성, 승계범위 등 개별 사실판단이 선행되어야 합니다.
근거
국세청 유권해석(서면-2014-법령해석부가-22066)에서 구체적 사실판단이 반드시 필요함을 강조하였습니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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요지

법인세법 요건을 갖춘 인적·물적분할의 경우 사업양도에 해당하나 이에 해당하는 지는 사실판단할 사항임

회신

산학협력단이 ⁠「산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률」제36조의2에 따라 기술지주회사를 ⁠「법인세법」 제47조제1항의 요건을 갖춘 분할을 통하여 설립하면서 부가가치세 과세사업 부문에 사용하던 특허 및 보유기술 등을 포함한 자산과 부채, 해당 연구인력 등을 승계시키는 경우 ⁠「부가가치세법」 제10조제8항에 따른 사업양도에 해당하는 것입니다.
다만, 양도대상이 되는 사업이 분리가능한 독립된 사업부문(사업장)에 해당하는지 및 ⁠「법인세법」 제47조제1항에 따른 물적분할 요건을 갖추었는지는 관련 사실을 종합하여 사실판단할 사항입니다.

1. 사실관계

 ○ A대학교 산학협력단(이하 "산단")은 해당 대학교 교수 및 연구원등의 연구성과를 통합․관리하여 왔으며 그동안 획득한 특허 등의 사업화 및 이전, 산학협력업무를 이행하여 왔으나 산단의 특성상 기술이전에 따른 보상을 배당이나 지분의 형태로 획득할 수 없는 등의 업무제한이 있음

○ ⁠「산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률」제36조의3(자회사의 설립 방식)의 규정이 2011.7.25. 추가됨에 따라 산학협력단이나 연구기관이 보유한 기술을 활용하여 자회사를 설립할 수 있는 근거를 마련하게 되었으며 2013.9.30.「법인세법」제46조 제2항 및 제47조의 요건을 충족하는 'A대학교기술지주회사'를 물적분할인 현물출자의 방식으로 설립

○ 산단은「법인세법」제47조에서 정한 물적분할을 통하여 분할신설법인의 주식등을 취득한 경우로서 ⁠「법인세법」제46조제2항에서 규정하는 분할등기일 현재 5년이상 사업을 계속하던 내국법인으로서 분리하여 사업이 가능한 독립된 사업부문을 분할하였고, 분할하는 사업부문이 자산 및 부채가 포괄적으로 승계되었고, 분할법인등만의 출자에 의하여 분할이 이루어짐

○ 분할법인등의 주주가 분할신설법인 등으로부터 받은 분할대가의 전액이 주식으로서 그 주식이 분할법인등의 주주가 소유하던 주식의 비율에 따라 배정되고 대통령령으로 정하는 분할법인등의 주주가 분할등기일이 속하는 사업년도 종료일까지 그 주식을 보유하고 있으며, 분할신설법인 등이 분할등기일이 속하는 사업년도의 종료일까지 분할법인등으로부터 승계받은 사업을 계속함

2. 질의내용

 ○ 산학협력단이 종전에 영위하던 기술이전 및 사업화 업무를 물적분할을 통하여「기술의 이전 및 사업화촉진에 관한 법률」에 따른 'A대학교기술지주회사'로 이관하는 경우 사업양도에 해당하는 지 여부

3. 관련법령 및 관련사례

부가가치세법 제10조 【재화 공급의 특례】

 ⑧ 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 것은 재화의 공급으로 보지 아니한다.

  1. 재화를 담보로 제공하는 것으로서 대통령령으로 정하는 것

  2. 사업을 양도하는 것으로서 대통령령으로 정하는 것. 다만, 제52조제4항에 따라 그 사업을 양수받는 자가 대가를 지급하는 때에 그 대가를 받은 자로부터 부가가치세를 징수하여 납부한 경우는 제외한다.

  3. 법률에 따라 조세를 물납(物納)하는 것으로서 대통령령으로 정하는 것

부가가치세법 시행령 제23조 【재화의 공급으로 보지 아니하는 사업 양도】

  법 제10조제8항제2호 본문에서 "대통령령으로 정하는 것"이란 사업장별(「상법」에 따라 분할하거나 분할합병하는 경우에는 같은 사업장 안에서 사업부문별로 구분하는 경우를 포함한다)로 그 사업에 관한 모든 권리와 의무를 포괄적으로 승계시키는 것(「법인세법」 제46조제2항 또는 제47조제1항의 요건을 갖춘 분할의 경우, 「조세특례제한법」 제37조제1항 각 호의 요건을 갖춘 자산의 포괄적 양도의 경우 및 양수자가 승계받은 사업 외에 새로운 사업의 종류를 추가하거나 사업의 종류를 변경한 경우를 포함한다)을 말한다. 이 경우 그 사업에 관한 권리와 의무 중 다음 각 호의 것을 포함하지 아니하고 승계시킨 경우에도 그 사업을 포괄적으로 승계시킨 것으로 본다.

  1. 미수금에 관한 것

  2. 미지급금에 관한 것

  3. 해당 사업과 직접 관련이 없는 토지ㆍ건물 등에 관한 것으로서 기획재정부령으로 정하는 것

법인세법 제46조 【분할 시 분할법인등에 대한 과세】

 ① 내국법인이 분할로 해산하는 경우[물적분할(물적분할)은 제외한다. 이하 이 조 및 제46조의2부터 제46조의4까지에서 같다]에는 그 법인의 자산을 분할신설법인 또는 분할합병의 상대방 법인(이하 "분할신설법인등"이라 한다)에 양도한 것으로 본다. 이 경우 그 양도에 따라 발생하는 양도손익(제1호의 가액에서 제2호의 가액을 뺀 금액을 말한다. 이하 이 조 및 제46조의3에서 같다)은 분할법인 또는 소멸한 분할합병의 상대방 법인(이하 "분할법인등"이라 한다)이 분할등기일이 속하는 사업연도의 소득금액을 계산할 때 익금 또는 손금에 산입한다.

  1. 분할법인등이 분할신설법인등으로부터 받은 양도가액

  2. 분할법인등의 분할등기일 현재의 순자산 장부가액

 ② 제1항을 적용할 때 다음 각 호의 요건을 갖춘 분할의 경우에는 제1항제1호의 가액을 분할법인등의 분할등기일 현재의 순자산 장부가액으로 보아 양도손익이 없는 것으로 할 수 있다. 다만, 대통령령으로 정하는 부득이한 사유가 있는 경우에는 제2호 또는 제3호의 요건을 갖추지 못한 경우에도 대통령령으로 정하는 바에 따라 양도손익이 없는 것으로 할 수 있다.

  1. 분할등기일 현재 5년 이상 사업을 계속하던 내국법인이 다음 각 목의 요건을 모두 갖추어 분할하는 경우일 것(분할합병의 경우에는 소멸한 분할합병의 상대방법인 및 분할합병의 상대방법인이 분할등기일 현재 1년 이상 사업을 계속하던 내국법인일 것)

   가. 분리하여 사업이 가능한 독립된 사업부문을 분할하는 것일 것

   나. 분할하는 사업부문의 자산 및 부채가 포괄적으로 승계될 것. 다만, 공동으로 사용하던 자산, 채무자의 변경이 불가능한 부채 등 분할하기 어려운 자산과 부채 등으로서 대통령령으로 정하는 것은 제외한다.

   다. 분할법인등만의 출자에 의하여 분할하는 것일 것

  2. 분할법인등의 주주가 분할신설법인등으로부터 받은 분할대가의 전액(분할합병의 경우에는 제44조제2항제2호의 비율 이상)이 주식으로서 그 주식이 분할법인등의 주주가 소유하던 주식의 비율에 따라 배정(분할합병의 경우에는 대통령령으로 정하는 바에 따라 배정한 것을 말한다)되고 대통령령으로 정하는 분할법인등의 주주가 분할등기일이 속하는 사업연도의 종료일까지 그 주식을 보유할 것

  3. 분할신설법인등이 분할등기일이 속하는 사업연도의 종료일까지 분할법인등으로부터 승계받은 사업을 계속할 것

법인세법 제47조 【물적분할 시 분할법인에 대한 과세특례】

 ① 분할법인이 물적분할에 의하여 분할신설법인의 주식등을 취득한 경우로서 제46조제2항 각 호의 요건(같은 항 제2호의 경우 전액이 주식등이어야 한다)을 갖춘 경우 그 주식등의 가액 중 물적분할로 인하여 발생한 자산의 양도차익에 상당하는 금액은 대통령령으로 정하는 바에 따라 분할등기일이 속하는 사업연도의 소득금액을 계산할 때 손금에 산입할 수 있다. 다만, 대통령령으로 정하는 부득이한 사유가 있는 경우에는 제46조제2항제2호 또는 제3호의 요건을 갖추지 못한 경우에도 자산의 양도차익에 상당하는 금액을 대통령령으로 정하는 바에 따라 손금에 산입할 수 있다.

산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률 제36조의2【기술지주회사의 설립ㆍ운영】

 ① 산학협력단 및 제2조제2호다목에 해당하는 산업교육기관 중 대통령령으로 정하는 산업교육기관(이하 ⁠“산학협력단등”이라 한다)은 단독으로 또는 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 기관과 공동으로 기술지주회사를 설립할 수 있다. ⁠(2011.7.25, 2013.12.30 개정)

  1. 다른 대학의 산학협력단

  2. 학교법인(그 학교에 산학협력단이 없는 경우만 해당한다)

  3. 연구기관

 ② 기술지주회사는 다음 각 호의 요건을 갖추어 교육부장관의 설립인가를 받아야 한다. 설립인가에 필요한 절차에 관하여는 교육부령으로 정한다.

  1. 주식회사일 것

  2. 임원이 「국가공무원법」 제33조제1항 각 호에 따른 결격사유에 해당하지 아니할 것

  3. 산학협력단등(제1항 각 호의 기관과 공동으로 기술지주회사를 설립하는 경우에는 제1항 각 호의 기관을 포함한다. 이하 같다)이 자본금의 100분의 30을 초과하여 기술을 현물출자하고, 발행 주식 총수의 100분의 50을 초과하여 보유할 것

  4. 그 밖에 대통령령으로 정하는 기준을 갖출 것

산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률 제36조의3【자회사의 설립 방식】

 ① 기술지주회사는 산학협력단등이나 연구기관이 보유한 기술을 활용하여 자회사를 설립할 수 있다.

 ② 기술지주회사는 직접 자회사를 설립하거나 대통령령으로 정하는 회사의 주식 또는 지분의 인수를 통하여 자회사로 할 수 있다.

 ③ 자회사는 주식회사 또는 유한회사로 한다.

산업교육진흥 및 산학연협력촉진에 관한 법률 제36조의4【자회사의 출자 등】

① 기술지주회사가 자회사에 기술을 현물출자하는 경우에는 제36조의2제3항을 준용한다.

② 기술지주회사에 출자하는 ⁠“기술”은 제2조제6호에 따른 기술이어야 하며, 정관을 인증받은 날부터 소급하여 1년 이내에 「기술의 이전 및 사업화 촉진에 관한 법률」 제23조에서 정하는 기술평가기관의 기술평가를 거쳐야 한다.

③ 기술지주회사에 현물출자된 기술을 현물출자일로부터 6개월 이내에 자회사에 현물출자하는 경우 기술지주회사 현물출자 시의 평가액을 자회사의 현물출자액으로 할 수 있다.

출처 : 국세청 2015. 06. 10. 서면-2014-법령해석부가-22066 | 국세법령정보시스템