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법인전환 이월과세 주식 처분시 사후관리 규정 적용

부동산납세과-762  ·  2014. 10. 13.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 2012.12.31. 이전에 조세특례제한법 제32조에 따라 이월과세를 적용받아 법인전환한 자가, 2013.1.1. 이후 해당 법인 설립일로부터 5년 이내 법인전환으로 취득한 주식의 50% 이상을 처분할 경우 개정된 사후관리규정이 적용되는지요?

S요약

2012년 12월 31일 이전에 사업용 고정자산을 법인으로 전환하여 이월과세를 적용받은 경우에도, 2013년 1월 1일 이후 해당 법인 설립일로부터 5년 이내에 주식의 50% 이상을 처분하면 개정된 사후관리규정이 적용되어, 이월과세액을 양도소득세로 납부해야 함이 안내됩니다.
#법인전환 #이월과세 #주식 50% 처분 #사후관리 #조세특례제한법 #양도소득세
핵심 정리

R회신 내용 부동산납세과-762  ·  2014. 10. 13.

  • 국세청 부동산납세과-762(2014.10.13), 서면법규과-1338(2013.12.16) 회신에 근거함.
  • 2012.12.31. 이전에 사업용 고정자산을 사업 양수도방법으로 법인전환하고 이월과세를 적용받은 거주자는, 2013.1.1. 이후 해당 법인 설립일로부터 5년 이내 법인전환 주식의 50% 이상을 처분하면 2013년 1월 1일 개정된 사후관리규정이 적용됨을 명시하였습니다.
  • 조세특례제한법 제32조 제5항 및 부칙 제11조에 따라, 처분일이 속하는 과세연도에 이월과세된 양도소득세(해당 법인이 이미 납부한 세액을 제외한 금액)를 양도소득세로 납부해야 함을 확인하였습니다.
  • 사후관리규정 적용 시점(2013년 1월 1일 이후 주식 50% 이상 처분)에 해당할 경우, 법 적용에 유의해야 함을 안내합니다.

L관련 법령 해석

  • 조세특례제한법 제32조(법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세): 법인전환 후 5년 이내 사업폐지, 자본금 50% 이상 유상감자, 또는 주식의 50% 이상 처분 시 이월과세한 양도소득세 납부 의무
  • 조세특례제한법 부칙(2013.1.1. 법률 제11614호) 제11조: 2013년 1월 1일 이후 사업폐지나 주식·출자지분 처분부터 개정된 사후관리규정 적용
  • 조세특례제한법 시행령 제29조 제6항, 제7항: 사업용 고정자산 처분, 주식의 유상이전·감자 등 사유별 구체적 적용 기준 및 예외 규정
사례 Q&A
1. 법인전환 이월과세 주식 50% 처분시 언제 사후관리 규정이 적용되나요?
답변
2013년 1월 1일 이후 해당 법인의 설립일부터 5년 이내에 법인전환으로 취득한 주식의 50% 이상을 처분하면 개정된 사후관리 규정이 적용됩니다.
근거
조세특례제한법 부칙(2013.1.1. 개정) 제11조에 따라 주식 처분일이 2013.1.1. 이후이면 사후관리 규정을 적용합니다.
2. 2012년 이전 법인전환한 경우에도 주식 처분 사후관리 의무가 있나요?
답변
네, 2012.12.31. 이전 법인전환이라도 2013.1.1. 이후 주식의 50% 이상을 처분하면 사후관리 의무가 발생할 수 있습니다.
근거
국세청 회신과 조세특례제한법 제32조 제5항 및 부칙 제11조가 이에 근거를 제공합니다.
3. 법인전환 이월과세 주식 처분시 어떤 세금을 어떻게 내야 하나요?
답변
해당 주식 처분일이 속하는 과세연도에 이월과세액(이미 납부한 세액 제외)을 양도소득세로 납부하셔야 합니다.
근거
조세특례제한법 제32조 제5항에 따라 처분 시점에서 이월된 양도소득세를 납부해야 함을 명시하고 있습니다.

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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요지

2012.12.31.이전 사업용 고정자산을 사업 양수도방법으로 법인전환하고 법인전환 이월과세를 적용받은 거주자가 2013.1.1.이후 해당 법인의 설립일로부터 5년 이내 법인전환으로 취득한 주식의 50% 이상 처분 시 개정된 사후관리규정이 적용됨

회신

귀 질의의 경우 기존해석사례(서면법규과-1338, 2013.12.16)를 참고하시기 바랍니다.
○ 서면법규과-1338(2013.12.16)
귀 서면질의의 경우, 2012.12.31. 이전 ⁠「조세특례제한법」제32조에 따라 사업용 고정자산을 사업 양도·양수의 방법으로 법인으로 전환하고 그 사업용고정자산에 대해 이월과세를 적용받은 거주자가 2013.1.1. 이후 해당 법인의 설립일로부터 5년 이내에 법인전환으로 취득한 주식의 100분의 50 이상을 처분하는 경우 같은 법(2013.1.1. 법률 제11614호로 개정된 것) 같은 조 제5항 및 같은 법 부칙 제11조에 따라 처분일이 속하는 과세연도의 과세표준신고를 할 때 이월과세액(해당 법인이 이미 납부한 세액을 제외한 금액을 말한다)을 양도소득세로 납부하여야 합니다.

  1. 질의내용 요약

  ○ 사실관계

  - 2012.03.00. 甲, 조특법 제32조에 따른 양도소득세 이월과세 적용

        ※ 甲은 사업의 포괄양수도방법에 따라 설립된 법인의 설립일부터 5년 이내에 법인전환으로 취득한 주식을 양도할 예정

  ○ 질의내용

   - 2013.1.1 법률 제11614호로 개정된 ⁠「조세특례제한법」부칙 제11조에 따르면, ⁠“제31조제7항 및 제32조제5항 개정규정은 2013년1월1일 이후 승계받은 사업을 폐지하거나 취득한 주식 또는 출자지분을 처분하는 분부터 적용한다”라고 규정하고 있는 바

   - 2012.12.31 이전 법인으로 전환하여 이월과세를 적용받은 경우 해당 부칙 규정의 적용대상인지 여부

2. 질의내용에 대한 자료

가. 관련 조세 법령 ⁠(법률, 시행령, 시행규칙, 기본통칙)

조세특례제한법((2011.12.31. 법률 제11133호로 개정된 것) 제32조 【법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세】

① 〜 ④ 생략

⑤ 제1항에 따라 설립되는 법인이 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 제1항에도 불구하고 대통령령으로 정하는 바에 따라 계산한 양도소득세 산출세액을 해당 거주자로부터 징수한다. ⁠(2011. 12. 31. 신설)

1. 해당 법인이 법인전환 후 5년 이내에 사업을 폐지하는 경우 ⁠(2011. 12. 31. 신설)

2. 해당 법인이 법인전환 후 5년 이내에 법인전환 당시 자본금의 100분의 50 이상을 유상감자 하는 경우 ⁠(2011. 12. 31. 신설)

조세특례제한법 부칙 ⁠(2011.12.31. 법률 제11133호)

제1조(시행일) 이 법은 2012년 1월 1일부터 시행한다. 단서생략

제12조(법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세에 관한 적용례) 제32조제5항의 개정규정은 2012년 1월 1일 이후 사업을 폐지하거나 유상감자하는 분부터 적용한다.

조세특례제한법(2013.1.1. 법률 제11614호로 개정된 것) 제32조 【법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세】

① 〜 ④ 생략

⑤ 제1항에 따라 설립된 법인의 설립일부터 5년 이내에 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 사유가 발생하는 경우에는 제1항을 적용받은 거주자가 사유발생일이 속하는 과세연도의 과세표준신고를 할 때 제1항에 따른 이월과세액(해당 법인이 이미 납부한 세액을 제외한 금액을 말한다)을 양도소득세로 납부하여야 한다. 이 경우 사업 폐지의 판단기준 등에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다. ⁠(2013. 1. 1. 개정)

1. 제1항에 따라 설립된 법인이 제1항을 적용받은 거주자로부터 승계받은 사업을 폐지하는 경우 ⁠(2013. 1. 1. 개정)

2. 제1항을 적용받은 거주자가 법인전환으로 취득한 주식 또는 출자지분의100분의 50 이상을 처분하는 경우 ⁠(2013. 1. 1. 개정)

조세특례제한법 부칙 (2013.1.1. 법률 제11614호)

제1조(시행일) 이 법은 2013년 1월 1일부터 시행한다

제11조(중소기업 간의 통합 및 법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세에 관한 적용례) 제31조제7항 및 제32조제5항의 개정규정은 2013년 1월 1일 이후 승계받은 사업을 폐지하거나 취득한 주식 또는 출자지분을 처분하는 분부터 적용한다.

조세특례제한법 시행령 제29조 【법인전환에 대한 양도소득세의 이월과세】

①〜⑤

⑥ 법 제32조제1항에 따라 설립되는 법인(이하 이 조에서 전환법인 이라 한다)이 같은 조 제1항에 따른 현물출자 또는 사업 양도·양수의 방법으로 취득한 사업용고정자산의 2분의1이상을 처분하거나 사업에 사용하지 않는 경우 법 제32조제5항제1호에 따른 사업의 폐지로 본다. 다만, 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 그러하지 아니한다.

1. 전환법인이 파산하여 승계받은 자산을 처분한 경우

2. 전환법인이 「법인세법」 제44조제2항에 따른 합병, 같은 법 제46조제2항에 따른 분할, 같은 법 제47조제1항에 따른 물적분할, 같은 법 제47조의2제1항에 따른 현물출자의 방법으로 자산을 처분한 경우

3. 전환법인이 법 제37조에 따른 자산의 포괄적 양도에 따라 자산을 장부가액으로 양도한 경우

4. 전환법인이 ⁠「채무자 회생 및 파산에 관한 법률」에 따른 회생절차에 따라 법원의 허가를 받아 승계받은 자산을 처분한 경우

⑦ 법 제32조제5항제2호의 처분은 주식 또는 출자지분의 유상이전, 무상이전, 유상감자 및 무상감자를 포함한다. 다만, 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우에는 그러하지 아니한다.

1. 법 제32조제1항을 적용받은 거주자(이하 이 조에서 해당 거주자 라 한다)가 사망하거나 파산하여 주식 또는 출자지분을 처분하는 경우

2. 해당 거주자가 「법인세법」 제44조제2항에 따른 합병이나 같은 법 제46조제2항에 따른 분할의 방법으로 주식 또는 출자지분을 처분하는 경우

3. 해당 거주자가 법 제37조에 따른 자산의 포괄적 양도, 법 제38조에 따른주식의 포괄적 교환·이전 또는 법 제38조의2에 따른 주식의 현물출자의방법으로 과세특례를 적용받으면서 주식 또는 출자지분을 처분하는 경우

4. 해당 거주자가 ⁠「채무자 회생 및 파산에 관한 법률」에 따른 회생절차에 따라 법원의 허가를 받아 주식 또는 출자지분을 처분하는 경우

5. 해당 거주자가 법령상 의무를 이행하기 위하여 주식 또는 출자지분을 처분하는 경우

나. 유사사례 ⁠(판례, 심판례, 심사례, 예규)

○ 서면법규과-1338, 2013.12.16

  〔 회 신 〕

「귀 서면질의의 경우, 2012.12.31. 이전 ⁠「조세특례제한법」제32조에 따라 사업용 고정자산을 사업 양도·양수의 방법으로 법인으로 전환하고 그 사업용고정자산에 대해 이월과세를 적용받은 거주자가 2013.1.1. 이후 해당 법인의 설립일로부터 5년 이내에 법인전환으로 취득한 주식의 100분의 50 이상을 처분하는 경우 같은 법(2013.1.1. 법률 제11614호로 개정된 것) 같은 조 제5항 및 같은 법 부칙 제11조에 따라 처분일이 속하는 과세연도의 과세표준신고를 할 때 이월과세액(해당 법인이 이미 납부한 세액을 제외한 금액을 말한다)을 양도소득세로 납부하여야 합니다.

출처 : 국세청 2014. 10. 13. 부동산납세과-762 | 국세법령정보시스템