유권해석

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특허권 실질적 통제권 이전 시 부가가치세 과세 및 매입세액 공제 여부

법규부가2014-547  ·  2014. 12. 16.
질의 및 요약

Q질의내용

  • 특허권 실질적 통제권이 투자신탁에 이전되는 경우 재화의 공급으로 보아 부가가치세 과세 및 관련 매입세액 공제가 가능한지, 그리고 공급시기는 언제로 보는지?

S요약

특허권의 실질적 통제권이 투자회사(투자신탁)에 이전될 경우, 해당 거래는 재화의 공급으로 보아 공급시점에 세금계산서 발급 및 매입세액 공제가 가능하다고 판단됩니다. 이는 형식이 아닌 실질에 따라 판단하며, 통제권이 투자회사로 유효하게 이전된 시점이 공급시기가 됩니다.
#특허권 양도 #실질적 통제권 #부가가치세 #재화의 공급 #매입세액 공제 #투자신탁
핵심 정리

R회신 내용 법규부가2014-547  ·  2014. 12. 16.

  • 회신 주체: 국세청, 출처: 법규부가2014-547(2014-12-16)
  • 당초 계약이 양도담보 성격으로 실제 실질적 통제권이 이전되지 않은 경우에는 부가가치세 과세대상 재화의 공급이 아니라고 회신(법규부가 2012-407 참조)
  • 그러나 계약 변경으로 인해 특허권의 실질적 통제권이 유효하게 투자회사(투자신탁)에 이전된 경우, 이는 부가가치세법상 재화의 공급에 해당하며, 공급시기는 실질적 통제권 이전 시점으로 판단됨
  • 투자회사가 이전받은 특허권을 부가가치세 과세사업에 사용 또는 사용할 예정일 때, 매입세액 공제가 가능함(부가가치세법 제38조 적용)
  • 세법 해석 시 형식이 아닌 거래의 실질에 따라 과세 여부 및 시기·세액 공제 가능 여부가 판단됨(국세기본법 제14조, 실질과세원칙)

L관련 법령 해석

  • 부가가치세법 제2조: 재화의 정의 및 범위를 정하며, 특허권 등 재산적 가치가 있는 권리도 재화에 포함됨
  • 부가가치세법 제10조 및 시행령 제22조: 양도담보 등은 재화의 공급으로 보지 않음을 명시
  • 부가가치세법 제15조 및 시행령 제28조: 재화의 공급 시기는 실질적 통제권 이전 등 거래별 확정 시점으로 규정
  • 부가가치세법 제38조: 과세사업에 사용하는 경우 매입세액 공제 가능
  • 국세기본법 제14조: 실질과세 원칙에 따라 거래의 실질 내용 기준으로 과세
사례 Q&A
1. 특허권 유동화 시 실질적 소유권 이전이 부가가치세 과세대상인가요?
답변
실질적 통제권이 투자회사에 이전된 경우에는 재화의 공급으로 보아 부가가치세가 과세될 수 있습니다.
근거
국세청 유권해석부가가치세법상 실질에 따라 과세 여부 결정
2. 특허권 양수자가 특허를 과세사업에 사용하면 매입세액 공제가 가능한가요?
답변
네, 특허권을 과세사업에 사용하는 경우 관련 매입세액은 부가가치세법 제38조에 따라 공제 가능합니다.
근거
부가가치세법 제38조국세청 회신에서 명확히 규정됨
3. 특허권 공급시기는 언제로 판단하나요?
답변
실질적 통제권이 이전되는 시점이 특허권의 공급시기로 판단됩니다.
근거
부가가치세법 제15조 및 시행령 제28조에 따른 거래별 공급시기 해석

* 중앙부처 1차 해석은 부처에서 해석한 내용을 수집·제공하는 공공데이터로, 현재 기준과 다를 수 있습니다. 구체적 사안은 소관 부처에 확인하거나 전문가 상담을 권장합니다.

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유권해석 전문

요지

특허권의 경제적 소유자가 투자회사에 특허권의 실질적인 통제권을 이전하는 경우 재화의 공급에 해당하고, 그 공급시기는 실질적 통제권이 이전되는 시점이며, 투자회사가 특허권을 과세사업에 사용하는 경우 관련 매입세액은 공제받을 수 있음

답변내용

내국법인(“을”)이 보유 중인 특허권에 대한 자산유동화를 위해 투자신탁(“갑”)에 양도하면서 해당 특허권 사용에 대한 전용실시권을 부여받고 일정기간이 경과한 후 해당 특허권을 재매수하는 거래가 특허권의 실질적 통제권의 이전을 수반하지 아니하는 차입거래에 해당하였으나, ⁠“갑”과 ⁠“을”이 당초 계약을 변경하여 ⁠“갑”이 ⁠“을”로부터 특허권에 대한 실질적 통제권을 이전받기로 한 경우에는 ⁠“갑”은 계약변경으로 실질적 통제권이 유효하게 이전되는 때를 공급시기로 하여 ⁠「부가가치세법」 제9조 및 같은 법 제32조에 따라 ⁠“을”에게 세금계산서를 발급하는 것이며, ⁠“갑”이 이전받은 특허권을 운용·처분하는 등의 부가가치세 과세사업에 사용하거나 사용할 예정인 경우 특허권을 취득하는 때에 부담한 매입세액은 ⁠「부가가치세법」 제38조제1항에 따라 매출세액에서 공제받을 수 있는 것임

1. 사실관계

○ ⁠“을”이 특허권 유동화 목적으로 특허권을 ⁠“갑”투자신탁에 양도하면서 특허권 전용실시권과 우선매수권을 부여받아 특허권을 사용하고 2년 후 해당 특허권의 양도금액과 동일한 금액으로 재매입하기로 하였으나

  - ⁠“을”이 경영실적 악화 등으로 매각 또는 청산 예정으로 당초 약정한 특허권 재매입 우선권행사의 이행이 불가능해 짐

  - 이에 따라 ⁠“갑”은 ⁠“을”의 특허권에 대한 전용실시권 부여계약 및 특허권 재매매계약을 별도의 책임추구 없이 합의 해지하여, 특허권에 대한 진정한 소유권을 확정하고자 ⁠“해지합의서(안)”를 작성함

  - 해지합의서(안)에는 특허권을 실질적으로 ⁠“갑”이 통제 소유하게 되고 ⁠“을”에게 통상 실시권을 부여하며, 추후 제3자에게 매각을 고려중임

○ ⁠“갑”은 ⁠「자본시장과 금융투자업에 관한 법률」 제6조제1항제3호에 따른 ⁠“집합투자업”을 영위하기 위해 설립된 AA자산운용 주식회사와 동 제6호에 따른 ⁠“신탁업”을 영위하는 BB은행 간 신탁계약으로 설립된 집합투자기구로서

  - 동법 제229조 제3호에 규정되어 있는 특별자산을 운용대상으로 하며, 동법 제9조 제18항 제1호에 해당하는 신탁 형태의 집합투자기구 즉 ⁠“투자신탁”에 해당함

○ ⁠“을”의 특허권 유동화거래가 차입거래인지 양도거래인지 여부에 대한 세법해석 사전답변신청에 대하여

  - 국세청은 특허권 양도와 특허권 전용실시권 및 재매입 거래가 약정내용 등 제반 사항으로 미루어 볼 때

 - 특허권 양도 형식을 취했더라도 실질적인 통제권이 이전되지 않아 부가가치세 과세대상 재화의 공급이 아니라 실질과세원칙 상 차입거래로 회신함(법규부가 2012-407, 2012.12.18.)

2. 질의내용

○ 거래의 실질상 양도담보 성격의 특허권 유동화거래에서 우선매수권이 있는 ⁠“을”의 재매입약정 등이 종료되어 장기대여금을 회수하는 대신 ⁠“을”의 특허권을 실질적으로 소유하게 된 경우

  - 특허권의 실질적 소유권이 ⁠“갑”에게 이전되는 것이 부가가치세 과세대상 거래인지와 관련 매입세액의 공제여부 및 공급시기가 언제인지 여부

3. 관련법령 및 관련사례

부가가치세법 제2조【정 의】

 1. "재화"란 재산 가치가 있는 물건 및 권리를 말한다. 물건과 권리의 범위에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

 2. "용역"이란 재화 외에 재산 가치가 있는 모든 역무(役務)와 그 밖의 행위를 말한다. 용역의 범위에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

 3. "사업자"란 사업 목적이 영리이든 비영리이든 관계없이 사업상 독립적으로 재화 또는 용역을 공급하는 자를 말한다.

부가가치세법 시행령 제2조【재화의 범위】

 ① ⁠「부가가치세법」제2조제1호의 물건은 다음 각 호의 것으로 한다.

  1. 상품, 제품, 원료, 기계, 건물 등 모든 유체물

  2. 전기, 가스, 열 등 관리할 수 있는 자연력

 ② 법 제2조제1호의 권리는 광업권, 특허권, 저작권 등 제1항에 따른 물건 외에 재산적 가치가 있는 모든 것으로 한다.

부가가치세법 제10조【재화 공급의 특례】

 ⑧ 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 것은 재화의 공급으로 보지 아니한다.

  1. 재화를 담보로 제공하는 것으로서 대통령령으로 정하는 것

부가가치세법 시행령 제22조【재화의 공급으로 보지 아니하는 담보 제공

  법 제10조제8항제1호에서 "대통령령으로 정하는 것"이란 질권, 저당권 또는 양도담보의 목적으로 동산, 부동산 및 부동산상의 권리를 제공하는 것을 말한다.

부가가치세법 제15조【재화의 공급시기】

 ① 재화가 공급되는 시기는 다음 각 호의 구분에 따른 때로 한다. 이 경우 구체적인 거래 형태에 따른 재화의 공급시기에 관하여 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.

  1. 재화의 이동이 필요한 경우: 재화가 인도되는 때

  2. 재화의 이동이 필요하지 아니한 경우: 재화가 이용가능하게 되는 때

  3. 제1호와 제2호를 적용할 수 없는 경우: 재화의 공급이 확정되는 때

 ② 제1항에도 불구하고 할부 또는 조건부로 재화를 공급하는 경우 등의 재화의 공급시기는 대통령령으로 정한다.

부가가치세법 시행령 제28조 【구체적인 거래 형태에 따른 재화의 공급시기】

 ② 반환조건부 판매, 동의조건부 판매, 그 밖의 조건부 판매한부 판매의 경우에는 그 조건이 성취되거나 기한이 지나 판매 확정되는 때를 공급시기로 본다.

부가가치세법 제26조 【재화 또는 용역의 공급에 대한 면세】

 ① 다음 각 호의 재화 또는 용역의 공급에 대하여는 부가가치세를 면제한다.

  11. 금융ㆍ보험 용역으로서 대통령령으로 정하는 것

부가가치세법 제38조 【공제하는 매입세액】

 ① 매출세액에서 공제하는 매입세액은 다음 각 호의 금액을 말한다.

  1. 사업자가 자기의 사업을 위하여 사용하였거나 사용할 목적으로 공급받은 재화 또는 용역에 대한 부가가치세액(제52조제4항에 따라 납부한 부가가치세액을 포함한다)

  2. 사업자가 자기의 사업을 위하여 사용하였거나 사용할 목적으로 수입하는 재화의 수입에 대한 부가가치세액

부가가치세법 제39조 【공제하지 아니하는 매입세액】

 ① 제38조에도 불구하고 다음 각 호의 매입세액은 매출세액에서 공제하지 아니한다.

  4. 사업과 직접 관련이 없는 지출로서 대통령령으로 정하는 것에 대한 매입세액

  7. 면세사업등에 관련된 매입세액(면세사업등을 위한 투자에 관련된 매입세액을 포함한다)과 대통령령으로 정하는 토지에 관련된 매입세액

부가가치세법 시행령 제40조 【면세하는 금융ㆍ보험 용역의 범위】

 ① 법 제26조제1항제11호에 따른 금융ㆍ보험 용역은 다음 각 호의 사업에 해당하는 역무로 한다.

  2. ⁠「자본시장과 금융투자업에 관한 법률」에 따른 다음 각 목의 사업

   다. 집합투자업. 다만, 집합투자업자가 투자자로부터 자금 등을 모아서 부동산, 실물자산 및 그 밖에 기획재정부령으로 정하는 자산에 운용하는 경우는 제외한다.

부가가치세법 시행규칙 제27조 【면세하지 아니하는 집합투자업자 등의 투자대상 자산의 범위】

  영 제40조제1항제2호다목 단서, 같은 항 제13호 단서, 같은 항 제14호 단서 및 같은 항 제16호 단서에서 "기획재정부령으로 정하는 자산"이란 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 자산을 말한다.

  1. 지상권·전세권·임차권 등 부동산의 사용에 관한 권리

  2. 어업권

  3. 광업권

  4. 그 밖에 제1호부터 제3호까지의 자산과 유사한 재산 가치가 있는 자산

국세기본법 제14조 【실질과세】

 ① 과세의 대상이 되는 소득, 수익, 재산, 행위 또는 거래의 귀속이 명의(名義)일 뿐이고 사실상 귀속되는 자가 따로 있을 때에는 사실상 귀속되는 자를 납세의무자로 하여 세법을 적용한다.

 ② 세법 중 과세표준의 계산에 관한 규정은 소득, 수익, 재산, 행위 또는 거래의 명칭이나 형식에 관계없이 그 실질 내용에 따라 적용한다.

 ③ 제3자를 통한 간접적인 방법이나 둘 이상의 행위 또는 거래를 거치는 방법으로 이 법 또는 세법의 혜택을 부당하게 받기 위한 것으로 인정되는 경우에는 그 경제적 실질 내용에 따라 당사자가 직접 거래를 한 것으로 보거나 연속된 하나의 행위 또는 거래를 한 것으로 보아 이 법 또는 세법을 적용한다.

법인세법 제4조 【실질과세】

 ① 자산(資産)이나 사업에서 생기는 수입의 전부 또는 일부가 법률상 귀속되는 법인과 사실상 귀속되는 법인이 서로 다른 경우에는 그 수입이 사실상 귀속되는 법인에 대하여 이 법을 적용한다.

 ② 법인세의 과세소득이 되는 금액의 계산에 관한 규정은 소득·수익 등의 명칭이나 형식에도 불구하고 그 실질내용에 따라 적용한다.

법인세법 제43조 【기업회계기준과 관행의 적용】

  내국법인의 각 사업연도의 소득금액을 계산할 때 그 법인이 익금과 손금의 귀속사업연도와 자산·부채의 취득 및 평가에 관하여 일반적으로 공정·타당하다고 인정되는 기업회계기준을 적용하거나 관행(慣行)을 계속 적용하여 온 경우에는 이 법 및 ⁠「조세특례제한법」에서 달리 규정하고 있는 경우를 제외하고는 그 기업회계의 기준 또는 관행에 따른다.

법인세법 시행령 제71조 【임대료 등 기타 손익의 귀속사업연도】

 ④ 법 제40조제1항 및 제2항을 적용할 때 ⁠「자산유동화에 관한 법률」 제13조에 따른 방법에 의하여 보유자산을 양도하는 경우 및 매출채권 또는 받을어음을 배서양도하는 경우에는 기업회계기준에 의한 손익인식방법에 따라 관련 손익의 귀속사업연도를 정한다.

법인세법 시행령 제79조 【기업회계기준과 관행의 범위】

  법 제43조에 따른 기업회계의 기준 또는 관행은 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 회계기준(해당 회계기준에 배치되지 아니하는 것으로서 일반적으로 공정·타당하다고 인정되는 관행을 포함한다)으로 한다.

  1. 국제회계기준

   1의2. ⁠「주식회사의 외부감사에 관한 법률」 제13조제1항제2호 및 같은 조 제4항에 따라 한국회계기준원이 정한 회계처리기준

   2. 증권선물위원회가 정한 업종별회계처리준칙

   3. ⁠「공공기관의 운영에 관한 법률」에 따라 제정된 공기업·준정부기관 회계규칙

   4. 기타 법령에 의하여 제정된 회계처리기준으로서 기획재정부장관의 승인을 얻은 것

자본시장과 금융투자업에 관한 법률 제6조【금융투자업】

 ① 이 법에서 "금융투자업"이란 이익을 얻을 목적으로 계속적이거나 반복적인 방법으로 행하는 행위로서 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 업(業)을 말한다.

  3. 집합투자업

  6. 신탁업

 ④ 이 법에서 "집합투자업"이란 집합투자를 영업으로 하는 것을 말한다.

 ⑤ 제4항에서 "집합투자"란 2인 이상에게 투자권유를 하여 모은 금전등 또는 「국가재정법」 제81조에 따른 여유자금을 투자자 또는 각 기금관리주체로부터 일상적인 운용지시를 받지 아니하면서 재산적 가치가 있는 투자대상자산을 취득·처분, 그 밖의 방법으로 운용하고 그 결과를 투자자 또는 각 기금관리주체에게 배분하여 귀속시키는 것을 말한다. 다만, 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우를 제외한다.

  1. 대통령령으로 정하는 법률에 따라 사모(私募)의 방법으로 금전등을 모아 운용·배분하는 것으로서 대통령령으로 정하는 투자자의 총수가 대통령령으로 정하는 수 이하인 경우

  2. 「자산유동화에 관한 법률」 제3조의 자산유동화계획에 따라 금전등을 모아 운용·배분하는 경우

  3. 그 밖에 행위의 성격 및 투자자 보호의 필요성 등을 고려하여 대통령령으로 정하는 경우

 ⑧ 이 법에서 "신탁업"이란 신탁을 영업으로 하는 것을 말한다.

자본시장과 금융투자업에 관한 법률 제9조【그 밖의 용어의 정의】

  이 법에서 "집합투자기구"란 집합투자를 수행하기 위한 기구로서 다음 각 호의 것을 말한다.

  1. 집합투자업자인 위탁자가 신탁업자에게 신탁한 재산을 신탁업자로 하여금 그 집합투자업자의 지시에 따라 투자·운용하게 하는 신탁 형태의 집합투자기구(이하 "투자신탁"이라 한다)

자본시장과 금융투자업에 관한 법률 제229조【집합투자기구의 종류】

  집합투자기구는 집합투자재산의 운용대상에 따라 다음 각 호와 같이 구분한다.

  3. 특별자산집합투자기구 : 집합투자재산의 100분의 40 이상으로서 대통령령으로 정하는 비율을 초과하여 특별자산(증권 및 부동산을 제외한 투자대상자산을 말한다)에 투자하는 집합투자기구

특허법 제94조(특허권의 효력)

  특허권자는 업으로서 특허발명을 실시할 권리를 독점한다. 다만, 그 특허권에 관하여 전용실시권을 설정하였을 때에는 제100조제2항에 따라 전용실시권자가 그 특허발명을 실시할 권리를 독점하는 범위에서는 그러하지 아니하다.

특허법 제100조(전용실시권*)

 ① 특허권자는 그 특허권에 대하여 타인에게 전용실시권을 설정할 수 있다.

  * 전용실시권(專用實施) : 특허권자가 그 특허발명에 대하여 기간·장소 및 내용의 제한을 기하여 다른 사람에게 독점적으로 허락한 실시권(전용실시권자는 민형사상의 권리 주장이 가능하며, 전용실시 기간 동안 특허권자는 해당 특허를 실시할 수 없음)

 ② 전용실시권을 설정받은 전용실시권자는 그 설정행위로 정한 범위에서 그 특허발명을 업으로서 실시할 권리를 독점한다.

 ③ 전용실시권자는 다음 각 호의 경우를 제외하고는 특허권자의 동의를 받아야만 전용실시권을 이전할 수 있다.

  1. 전용실시권을 실시사업(實施事業)과 함께 이전하는 경우

  2. 상속이나 그 밖의 일반승계의 경우

특허법 제102조(통상실시권)

 ① 특허권자는 그 특허권에 대하여 타인에게 통상실시권을 허락할 수 있다.

 ② 통상실시권자는 이 법에 따라 또는 설정행위로 정한 범위에서 특허발명을 업으로서 실시할 수 있는 권리를 가진다.

출처 : 국세청 2014. 12. 16. 법규부가2014-547 | 국세법령정보시스템