요지

내국법인이 미환류소득에 대한 법인세를 신고함에 있어 2018사업연도에 대해서는 투자제외방법을 선택하여 신고하고, 2019 및 2020사업연도에 대해서는 투자포함방법을 선택하여 신고한 경우 해당 내국법인은 2019 및 2020사업연도에 대하여 투자제외방법으로 변경하기 위하여 수정신고를 할 수 있는 것임

답변내용

귀 사전답변 신청의 사실관계와 같이, 내국법인이 미환류소득에 대한 법인세를 신고함에 있어 2018사업연도에 대해서는 ｢조세특례제한법 시행령｣ 제100조의32제15항제2호의 방법을 선택하여 신고하고, 2019 및 2020사업연도에 대해서는 같은 항 제1호의 방법을 선택하여 신고한 경우 해당 내국법인은 2019 및 2020사업연도에 대하여 같은 항 제2호의 방법으로 변경하기 위하여 ｢국세기본법｣ 제45조에 따른 수정신고를 할 수 있는 것입니다.

1. 사실관계

 ○A법인은 ｢조세특례제한법｣ 제100조의32에 따른 투자ㆍ상생협력 촉진을 위한 과세특례를 적용받는 법인임

 ○A법인은 2018사업연도 귀속 미환류소득에 대한 법인세 신고시 ｢조세특례제한법｣ 제100조의32제2항제2호에 따른 투자제외방법을 선택하였고,

  -2019사업연도 귀속 미환류소득에 대한 법인세 신고시에는 같은 항 제1호에 따른 투자포함방법을 선택하였으며,

  -｢조세특례제한법 시행령｣ 제100조의32제15항제1호에 따라 2020사업연도 법인세 신고시에도 투자포함방법을 적용하였음

 ○A법인은 수정신고를 통해 아래와 같이 방법을 변경하고자 함

2. 질의내용

 ○2019사업연도 귀속 미환류소득에 대한 법인세 신고시 투자포함방법을 선택하여 2020사업연도까지 적용한 내국법인이

  -2019~2020사업연도에 대한 수정신고를 통해 투자제외방법으로 변경할 수 있는지 여부

3. 관련법령

○조세특례제한법 제100조의32【투자ㆍ상생협력 촉진을 위한 과세특례】

 ①다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 내국법인이 제2항제1호가목부터 다목까지의 규정에 따른 투자, 임금 등으로 환류하지 아니한 소득이 있는 경우에는 같은 항에 따른 미환류소득(제5항에 따른 차기환류적립금과 제7항에 따라 이월된 초과환류액을 공제한 금액을 말한다)에 100분의 20을 곱하여 산출한 세액을 미환류소득에 대한 법인세로 하여 ｢법인세법｣ 제13조에 따른 과세표준에 같은 법 제55조에 따른 세율을 적용하여 계산한 법인세액에 추가하여 납부하여야 한다.

  1.각 사업연도 종료일 현재 대통령령으로 정하는 자기자본이 500억원을 초과하는 법인. 다만, 다음 각 목의 어느 하나에 해당하는 법인은 제외한다.

   가. 대통령령으로 정하는 중소기업

   나. 대통령령으로 정하는 비영리법인

   다.제104조의31제1항 및 ｢법인세법｣ 제51조의2제1항 각 호의 어느 하나에 해당하는 법인

  2.각 사업연도 종료일 현재 ｢독점규제 및 공정거래에 관한 법률｣ 제31조제1항에 따른 상호출자제한기업집단에 속하는 법인

 ②제1항 각 호에 따른 내국법인은 다음 각 호의 방법 중 어느 하나를 선택하여 산정한 금액(산정한 금액이 양수인 경우에는 "미환류소득"이라 하고, 산정한 금액이 음수인 경우에는 음의 부호를 뗀 금액을 "초과환류액"이라 한다. 이하 이 조에서 같다)을 각 사업연도의 종료일이 속하는 달의 말일부터 3개월(｢법인세법｣ 제76조의17에 따라 법인세의 과세표준과 세액을 신고하는 경우에는 각 연결사업연도의 종료일이 속하는 달의 말일부터 4개월) 이내에 대통령령으로 정하는 바에 따라 납세지 관할 세무서장에게 신고하여야 한다.

  1.해당 사업연도(2022년 12월 31일이 속하는 사업연도까지를 말한다)의 소득 중 대통령령으로 정하는 소득(이하 이 조에서 "기업소득"이라 한다)에 100분의 60부터 100분의 80까지의 범위에서 대통령령으로 정하는 비율을 곱하여 산출한 금액에서 다음 각 목의 금액의 합계액을 공제하는 방법

   가. ~ 다. ⁠(생략)

  2. 기업소득에 100분의 10부터 100분의 20까지의 범위에서 대통령령으로 정하는 비율을 곱하여 산출한 금액에서 제1호 각 목(가목에 따른 자산에 대한 투자 합계액은 제외한다)의 합계액을 공제하는 방법

 ③제1항 각 호에 따른 내국법인이 제2항 각 호의 방법 중 어느 하나를 선택하여 신고한 경우 해당 사업연도의 개시일부터 대통령령으로 정하는 기간까지는 그 선택한 방법을 계속 적용하여야 한다.

○조세특례제한법 시행령 제100조의32【투자ㆍ상생협력 촉진을 위한 과세특례】

 ⑮법 제100조의32제3항에서 "대통령령으로 정하는 기간"이란 다음 각 호의 구분에 따른 기간을 말한다.

  1.내국법인이 법 제100조의32제2항제1호의 방법을 선택하여 신고한 경우 : 3년이 되는 날이 속하는 사업연도

  2.내국법인이 법 제100조의32제2항제2호의 방법을 선택하여 신고한 경우 : 1년이 되는 날이 속하는 사업연도

○국세기본법 제45조【수정신고】

 ①과세표준신고서를 법정신고기한까지 제출한 자(｢소득세법｣ 제73조제1항제1호부터 제7호까지의 어느 하나에 해당하는 자를 포함한다) 및 제45조의3제1항에 따른 기한후과세표준신고서를 제출한 자는 다음 각 호의 어느 하나에 해당할 때에는 관할 세무서장이 각 세법에 따라 해당 국세의 과세표준과 세액을 결정 또는 경정하여 통지하기 전으로서 제26조의2제1항부터 제4항까지의 규정에 따른 기간이 끝나기 전까지 과세표준수정신고서를 제출할 수 있다.

  1.과세표준신고서 또는 기한후과세표준신고서에 기재된 과세표준 및 세액이 세법에 따라 신고하여야 할 과세표준 및 세액에 미치지 못할 때

  2.과세표준신고서 또는 기한후과세표준신고서에 기재된 결손금액 또는 환급세액이 세법에 따라 신고하여야 할 결손금액이나 환급세액을 초과할 때

  3.제1호 및 제2호 외에 원천징수의무자의 정산 과정에서의 누락, 세무조정 과정에서의 누락 등 대통령령으로 정하는 사유로 불완전한 신고를 하였을 때(제45조의2에 따라 경정 등의 청구를 할 수 있는 경우는 제외한다)

출처 : 국세청 2022. 03. 30. 사전-2022-법규법인-0232[법규과-1046] | 국세법령정보시스템